1.與妊娠有關的各種子宮出血：子宮肥大癥可見陰道流血量多，但無停經史，亦無早孕反應；而與妊娠有關的各種子宮出血，如流產、葡萄胎等，均有停經史，且妊娠試驗、B超檢查均有助于鑒別診斷。
2.功能失調性子宮出血：功能失調性子宮出血患者，子宮出血多無規律性，且多發生于青春期及更年期，子宮無增大或僅稍許增大；子宮肥大癥則多發生在育齡及多產婦女，出血多表現為量多而周期正常或縮短，子宮增大明顯，呈鴨卵大甚至鵝卵大。
3.子宮肌瘤：子宮肥大癥容易與小的壁間肌瘤或宮腔內粘膜下肌瘤混淆。此癥亦表現為子宮增大、月經過多，但雙合診可發現子宮質硬或有凹凸不平感。通過B超檢查，可明確診斷。
4.子宮腺肌癥：亦表現為子宮一致性增大，一般不超過3個月妊娠大小，同時伴有病經或月經紊亂，月經期前子宮較平時略增大，也稍軟，月經后則恢復至平時大小。