維生素B1缺乏常罹及神經系統和心血管系統：以神經系統病變為主，無充血性心力衰竭者稱為干性腳氣病；以心血管病變為主，出現充血性心力衰竭者稱為濕性腳氣病。干性腳氣病侵犯周圍神經，為非炎癥性髓鞘變性。嚴重者侵犯中腦上部、中腦導水管周圍灰質、丘腦下部、第三腦室、第四腦室和小腦，表現為血管擴張、血管增生、血管周圍點狀出血、腦細胞壞死和膠質增生。濕性腳氣病心臟病理變化屬非特異性改變。尸檢示心肌肥厚、心肌細胞和傳導系統呈退行性變、水腫和壞死。大量淋巴細胞浸潤，心肌間質水腫明顯。雙心室擴張肥大，以右心室受累為主。
