患急性胃炎的患兒幾乎均述上腹部疼痛，以上腹痛為主要癥狀者應與下列疾病鑒別：
1.急性胰腺炎
有突然發作的上腹部劇烈疼痛，放射至背部及腰部，常伴惡心、嘔吐和發熱。血清淀粉酶升高。B超或CT顯示胰腺腫大，嚴重患者腹腔穿刺可抽出血性液體且淀粉酶增高。
2.腸蛔蟲癥及膽道蛔蟲癥
（1）腸蛔蟲癥常有不固定腹痛、偏食、異食癖、惡心嘔吐。有排出蛔蟲史，糞便查出蛔蟲卵。
（2）膽道蛔蟲癥驟然發生上腹部劇烈絞痛，可放射至左、右肩部及背部，發作時輾轉不安，劍突下偏右壓痛明顯，可伴嘔吐，有時吐出蛔蟲，B超見膽總管內有蟲體異物。
此外，患兒腹痛還要與外科急腹癥、肺部疾病相鑒別。