發病機制取決于血管損害、血小板減少以及腦、腎、心內膜、心肌、胃和腸出血的程度。病毒主要侵犯血管和神經系統，皮膚、黏膜和內臟血管均有充血、內皮細胞受損，使血管通透性增加，產生組織充血、水腫。腦水腫可引起感覺改變。血管張力減退可導致虛脫和休克。肝臟庫普弗細胞可見含鐵血黃素沉積。
