衛生條件及營養狀況的改善，不能減少輪狀病毒腹瀉的發病率。由于尚無治療輪狀病毒腹瀉的特效藥物（主要采用對癥治療，糾正脫水，維持電解平衡），因此，預防顯得極為重要。
1、一般預防
一般的預防措施，包括鼓勵母乳喂養，養成良好的衛生習慣；少帶孩子到公共場合，避免交叉感染；及時給孩子增減衣服。但最有效的預防手段是免疫接種。世界衛生組織（WHO）認為：除了疫苗，沒有一種有效方法能夠完全消除輪狀病毒或它的傳播。 實踐證明，接種輪狀病毒疫苗可以有效地減少或減輕腹瀉癥狀，進而降低發病率和死亡率，是預防嬰幼兒輪狀病毒腹瀉尤其是重癥腹瀉唯一和最經濟的手段。
注意飲食衛生：加強衛生宣教，對水源和食品衛生嚴格管理。食品應新鮮、清潔，凡變質的食物均不可喂養小兒，食具也必須注意消毒。
提倡母乳喂養母乳是六個月以內嬰兒最適宜的食物，應大力提倡小嬰兒按需喂養。人乳中含有IgA，可中和大腸桿菌腸毒素，有預防感染埃希氏大腸桿菌的作用。
按時添加輔食：小兒在添加輔助食物時必須注意從少到多，逐漸增加，使嬰兒有個適應過程；從稀到稠，先喝米湯，漸漸過渡到稀飯、軟飯；從細到粗，如加水果時，開始喂果汁，爾后吃果泥。五個月試加雞蛋黃、魚泥、嫩豆腐；七個月以后可添加富有營養、適合其消化吸收的食物，如魚、肉末、青菜、餅干等，逐漸為斷奶做些必要準備，但應避免在夏天斷奶。
在逐漸添加食物時，最好先習慣一種食物后再加另一種食物，不要同時添加幾種如遇小兒生病應暫時不加另一種食物。食欲不振時，不宜強制進食。
增強體質：平時應加強戶外活動，提高對自然環境的適應能力，注意小兒體格鍛煉，增強體質，提高機體抵抗力，避免感染各種疾病。
避免不良刺激：小兒日常生活中應防止過度疲勞、驚嚇或精神過度緊張。
加強體弱嬰幼兒護理：營養不良、佝僂病及病后體弱小兒應加強護理，注意飲食衛生，避免各種感染。對輕型腹瀉應及時治療，以免拖延成為重型腹瀉。
避免交叉感染：感染性腹瀉易引起流行，對新生兒，托幼機構及醫院應注意消毒隔離。發現腹瀉患兒和帶菌者要隔離治療，烘便應做消毒處
理。
合理應用抗生素：避免長期濫用廣譜抗生素，以免腸道菌群失調，招致耐藥菌繁殖引起腸炎。
2、輪狀病毒疫苗接種
輪狀病毒疫苗的免疫接種對象為2個月以上的兒童，主要為6個月至3歲的嬰幼兒。接種方式為口服；免疫程序為每次一劑，每年免疫一次。發燒、患嚴重疾病、胃腸疾患、嚴重營養不良、有免疫缺陷和接受免疫抑制劑治療者不要接種或暫緩接種。