1.血常規檢查
測試血小板，出、凝血時間，凝血酶原時間等一般性檢查。血小板是血液中最小的細胞，可保護毛細血管的完整性。有效的血小板質量和數量在機體正常止血過程中發揮著重要作用。若為全身性出、凝血疾病，出、凝血檢查有異常改變，如DIC或維生素K缺乏癥等。先天性同種免疫性或被動免疫性血小板減少性紫癜或各種先天性凝血因子缺乏癥等患兒，出、凝血相異常。
2.糞便檢查
糞便隱血試驗是指在消化道出血量很少時，肉眼不能見到糞便中帶血，并且糞便中有少量紅細胞被破壞。對消化道出血的診斷有重要價值，現常作為消化道惡性腫瘤早期診斷的一個篩選指標。若發現紅細胞，則結果為潛血試驗強陽性。急性胃腸炎患兒可有黏液血便，鮮血便等。
3.Apt試驗
用以鑒別血液為母血還是新生兒自身的血。若試液由粉紅色轉變成黃棕色，說明其為成人型血紅蛋白（HbA），即說明血液為母血；如仍為粉紅色則血液來自新生兒，新生兒咽入自己鼻咽腔或氣道中的血液，主要為胎兒型血紅蛋白（HbF）。
4.X線檢查
（1）腹部平片 采取仰臥、直立或側臥位腹部平片，可排除腸梗阻和腸穿孔，對新生兒小腸扭轉、壞死性腸炎及胎糞性腹膜炎尤為重要。
（2）鋇劑造影 稀鋇餐在非急性出血期造影是有一定價值的，常加甲基纖維素作雙層對比。也可在十二指腸插管后注入鋇劑作小腸造影檢查（加或不加甲基纖維素）。鋇灌腸常有助于腸套疊的診斷。①直接征象 發現胃和十二指腸壁龕影可確診。②間接征象 潰瘍對側切跡、十二指腸痙攣、畸形，對本病有診斷參考價值。因小兒潰瘍淺表鋇餐通過快，檢出率較成人為低，且假陽性率較高。氣、鋇雙重造影效果較佳。
5.內鏡
（1）纖維食管鏡、胃鏡、十二指腸鏡檢查 在食管、胃的連接部，淡紅色的食管黏膜與桔紅色的胃黏膜有明顯的分界線，兩者互相交錯，構成齒狀樣。此項目優于X線鋇劑造影。能確定Treitz韌帶以上或以下部位出血；能看到出血來源（陽性率高）及具體出血情況；能在直視下進行活檢和止血；并能觀察到X線檢查不易發現的淺表、微小病變；在急性出血時亦可進行檢查。小兒用GIF-P2或GIF-P3型鏡，在全麻或局麻加安定及阿托品下進行，鏡檢前必須糾正凝血障礙和血流動力學的不穩定狀態，保持呼吸道通暢，并用抗生素預防感染。
（2）纖維直腸鏡、結腸鏡檢查 首先進行直腸鏡檢查。做結腸鏡檢查前，一般先做鋇劑灌腸檢查，此與上消化道鏡檢查有所不同。用PCF（Olympus）或FC-34MA型內鏡，小嬰兒也可用小口徑胃鏡替代。纖維結腸鏡檢查主要是進行大腸檢查，全結腸鏡亦可進行部分回腸檢查。禁忌證：腹膜炎，腸穿孔，腹腔內廣泛粘連者；癌腫晚期伴有腹腔內廣泛轉移者；細菌性痢疾活動期；直腸、肛管、肛門周圍的急性炎癥病變；有嚴重的心、腦血管病，對檢查不能耐受者。
6.核素掃描
是一種有效而準確的檢查方法。利用99mTc-硫膠或其他锝酸鹽標記的紅細胞掃描，主要用于上述檢查方法未能明確診斷的反復間斷的消化道出血患兒，對美克爾憩室、消化道重復畸形等有診斷價值。
7.血管造影術
用于1.5～2.0ml/min以上的出血病例檢查。因有上述一系列更先進無損傷的檢查方法，目前此方法已很少用。