無論從解剖學還是生理學來看，鼻腔與支氣管及肺的關系非常密切。呼吸道是指從鼻孔開始至呼吸性細支氣管,其表面覆蓋纖毛上皮組織。上、下呼吸道在功能上是相互關聯的，刺激鼻黏膜（如鼻黏膜激發試驗）可引起氣道反應性的改變。過敏性鼻炎患者的鼻內炎性分泌物可以經鼻后孔和咽部流入或吸入肺內，稱為鼻后滴漏綜合癥。特別是仰臥位睡眠時鼻內炎性分泌物不知覺地流入氣道，極可能是過敏性鼻炎發展為哮喘病（特別是夜間哮喘）的重要原因。呼吸方式的改變也是導致過敏性鼻炎和哮喘病關系密切的因素之一，由于鼻粘膜腫脹、鼻甲肥大和分泌物的潴留可導致鼻塞，使患者被迫從以鼻呼吸為主轉變為以口呼吸為主，這樣過敏原可以避開鼻黏膜屏障而直接進入下呼吸道而引發哮喘。
然而，上呼吸道和下呼吸道是有差異的。在上呼吸道，鼻腔的阻塞是由鼻黏膜的血管充血或鼻息肉導致的；而在下呼吸道，支氣管通氣功能障礙則主要是由支氣管的環狀平滑肌收縮和氣道黏膜炎癥水腫共同引起。在氣流吸入的物理機制方面，上呼吸道的物理過濾功能，共鳴作用，散熱和濕潤功能，可使大于5-6微米的吸入顆粒阻擋在鼻腔，并使吸入支氣管的空氣保持濕潤且接近37℃。上呼吸道物理功能的失調可導致下呼吸道穩態變化。在哮喘病人因用口過度換氣，吸入高流量的冷空氣，可降低FEV1并增加氣道通氣阻力。