絕大多數非酒精性脂肪性肝病預后良好,肝組織學進展緩慢甚至呈靜止狀態,預后相對良好。部分患者即使已并發脂肪性肝炎和肝纖維化,如能得到及時診治,肝組織學改變仍可逆轉,罕見脂肪囊腫破裂并發脂肪栓塞而死亡。少數脂肪性肝炎患者進展至肝硬化,一旦發生肝硬化則其預后不佳。對于大多數脂肪肝患者,有時通過節制飲食、堅持中等量的有氧運動等非藥物治療措施就可達到控制體重和血糖、降低血脂及促進肝組織學逆轉的目的。