1.滋養體
⑴細胞表面結構：通過掃描電鏡觀察，Mccaul等（1977）首先發現滋養體表面有2～3μm長的微絲偽足（microfilopoodia）。Lushbaugh等（1979）報告，活的滋養體表面呈波浪形，具有細的皺紋，間有不規則的突出小梁，還有明顯的葉狀偽足（lobopodia）以及較長的絲狀偽足(filopodia)，其數不定。透射電鏡觀察，這種絲狀偽足長度自數μm至30μm以上，直徑達0.1μm，其表面有單位膜結構，由質膜的延伸構成。以上兩人選我述微絲偽足和絲狀偽足似為同物。
透射電鏡觀察，滋養體的質膜是典型的單位膜，兩層較薄的電子致密層（每層厚35～40Å；），中夾層透明且較寬（45～50Å；），厚度共120Å；（Ludvik,1970）。從腸組織所得的阿米巴的質膜外面，有一層厚約300Å；的絨毛狀外被(fazzy coal)，而培養的阿米巴則無。也許是蟲體的分泌物或抗原抗體的復合物，有待證實。
⑵細胞質：通過透射電鏡觀察，其溶組織內阿米巴滋養體的細胞質含有許多泡狀結構，包括空泡、食物泡和大量大小不等的糖原粒。食物泡大小不等（0.5～12μm），其膜的結構與質膜相同，推測是在吞噬過程中由質膜包裹而成；泡內含一種食物，這可能是各個食物泡各具有特定的消化酶的關系。還有微管及更小的空泡狀溶酶體〔直徑（5～20）×10-9m〕；由膜形成的內質網，量少，呈小管狀或小泡狀，其表面無核蛋白體附著。另外可見聚集成螺旋構型的核蛋白體。
⑶細胞核：呈不規則圓形，核膜為典型單位膜，厚12×10-9m，有許多核孔，孔徑大多為5×10-9m，核質顆粒狀，電子密度高于細胞質，核膜內緣有積聚成族的染色質粒，它富含核糖核酸（RNA），以3H-尿苷標記測出此為RNA的合成與積聚部位（Albach等，1977），另從3H0胸苷的消耗測出具有脫氧核糖核酸（DNA）。推測它們可能為某些類型的信息核糖核酸（mRNA）的形態基礎，確切結論有待這種顆粒的提鈍與生化分析。核仁居中，但不規則，由許多極小的致密的電子顆粒組成。
2.包囊：
Proctor等（1973）從糞便收集的溶組織內阿米巴包囊，用透射電鏡觀察，發現囊壁有兩層，外層為電子密度低的絨毛狀外被，厚40nm，內層為電子密度高的纖維結構層，厚80nm。整個囊壁厚120nm。囊壁內層之內為包繞細胞質的質膜，厚10nm，其內緣有間隔分布的嗜鋨小體（osmophilic），大小為30～80nm。細胞質中有許多細胞器，如同滋養體所見。糖原粒甚多，遍布于整個細胞質中，有的積聚成塊。擬染色體為電子致密顆粒組成。還有許多大小不等的空泡，有的泡內還有食物殘查。細胞核的大小，平均1.7×1.6μm，核膜及核內結核與滋養體相同。