鑒別診斷要考慮慢性或急性闌尾炎，根據我們治療的腸系膜淋巴結結核患兒曾被誤診為闌尾炎者最多，甚至誤診達2～3年之久。其次為肝炎非特異性腸系膜淋巴結炎，包蟲病、蛔蟲病等偶需鑒別者。尚有胃及十二指腸潰瘍、膽囊炎、腹部淋巴結腫塊應與限局性回腸炎、淋巴肉瘤及其他腹部腫瘤相鑒別。
