埃博拉病毒粒子外觀呈線狀，直徑為80nm，長度為970nm，屬絲狀病毒科埃博拉病毒屬。較長的奇形怪狀的病毒粒子相關結構可呈分枝狀或盤繞狀，長達10um。來自扎伊爾、象牙海岸和蘇丹的埃博拉毒株其抗原性和生物學特性不同。第4個埃博拉毒株（Reston）能引起人以外的靈長目動物致命性的出血性疾病；也有文獻報道，極少數人感染染此病毒株，但臨床上無癥狀。埃博拉病毒對熱有中等抵抗力，對紫外線和γ射線敏感，對多種化學試劑（乙醚、去氧膽酸鈉、β－丙內酯、過氧乙酸、次氯酸鈉、福爾馬林等）敏感。靈長類動物對埃博拉病毒普遍易感。