埃可病毒是引起出疹性發熱主要的病原。以中樞神經系統感染最常見，呼吸道感染也多見。各種不同亞型的病毒可引起不同的癥狀表現。
1.無菌性腦膜炎
是最常引起的中樞神經系統疾病，除埃可24，26，29和32型病毒外均可引起腦膜炎，病程一般為7～10天，以埃可4，6，9，11，16和30型病毒為最常見，既可引起散發性發病，也可引起暴發流行，埃可2～7，11，14～19，25，30，31和33型病毒曾從腦脊液或其他腸道外來源被分離出。
2.腦炎
埃可2～4、6、7、9、11、14、16、18、19和30型病毒均可引起腦炎癥狀類似于乙型腦炎，埃可4、6、9、30型病毒尤為常見，其中2，6，9，17和19型曾從腦脊液或其他腸道外來源分離。
3.癱瘓性疾患
埃可1～4、6、7、9、11、14、16、18、19、30型病毒皆可引起類似于脊髓灰質炎的癱瘓性疾患，但肌肉癱瘓程度較輕，恢復快而完全，其中4，6，9，11，16，19，30型曾從腦脊液或其他腸道外來源分離。
4.出疹性發熱
埃可病毒是引起出疹性發熱主要的病原，皮疹的發病原理還未明了，尚未有報告從斑丘疹和瘀斑中分離出病毒，因此還不清楚是病毒本身所引起或由免疫機制所致，目前診斷主要依靠從皰疹，血液，糞便或咽部分泌物中分離病毒。
腸道病毒性皮疹可作為埃可病毒在人群中流行的標志，由于容易和一些重要的發疹性傳染病相混淆而需要加以鑒別，因此，可按其模擬的疾病而分類。
（1）風疹或麻疹樣皮疹 埃可9型病毒是最常見與風疹樣皮疹相關的病毒，表現為細小的斑丘疹，在夏季流行，皮疹特征為與發熱同時出現，首先發生于面部（所有病例），然后蔓延到頸部（75%），胸部（64%）和四肢（56%），疹子數量極多，粉紅色，直徑1～3毫米，不癢不脫屑，與風疹極為相似，埃可2，4，11，19和25型病毒也曾引起多個小型暴發流行。
（2）薔薇疹樣皮疹 埃可16型病毒所引起薔薇疹樣皮疹特征不在于外表，而在于出現時間，這種皮疹要到熱退以后才出現，一般體溫在38℃～39℃之間，持續24～36小時，退熱后即出現稀疏，不癢的，粉紅色斑疹和丘疹，直徑0.5～1.5毫米，先發生在顏和上胸部，四肢較少見，皮疹持續1～5天后消退，出疹時間并非固定不變，由埃可16型病毒引起的皮疹也可與發熱同時出現，埃可11，15型病毒也可引起類似臨床表現。
（3）皰疹樣皮疹 埃可11型病毒可引起全身性皰疹樣皮疹，除具有手，足，口腔病特征外，皰疹分批出現于頭部，軀干和四肢，不發展成膿皰，也不結痂，可發生于免疫抑制的成年人，此外，曾有埃可6型病毒可引起類似于帶狀皰疹的皮疹，并從大皰中分離出該病毒的報道。
（4）瘀點樣皮疹和其他皮膚表現 埃可9型病毒可引起瘀點和瘀斑，并容易和流行性腦膜炎相混淆，特別當無菌性腦膜炎同時存在時。
5.急性胃腸炎
許多埃可病毒，特別是11，18，22以及1，3，6，9，14，19型，可引起小兒急性胃腸炎，表現為疲乏與腹瀉，水樣便，24小時后有寒戰，嘔吐，腹痛和肌痛，48小時內可有發熱，大便稀薄帶水，呈黃色或黃綠色，混有小量黏液，偶爾帶血，每日排便5～6次至10余次不等，臨床上一般不出現脫水癥狀，于48小時內迅速恢復，僅個別患兒的病情較嚴重，出現脫水，酸中毒等癥狀，在咽洗液，血及糞內可分離出病毒，但排毒時間大多短暫（不超過36小時）。
6.呼吸道感染
埃可4、7、20和25型病毒可引起流感樣癥狀表現；19、20型病毒在兒童中可引起肺炎；9型病毒在成人中可引起支氣管肺炎。
7.心肌炎與心包炎
埃可1、4、6、8、9、14、19、22、25、30型病毒都可引起急性心肌炎和心包炎。
8.流行性胸痛
埃可6、9、25～32型病毒可引起流行性胸痛。
9.非特異性發熱
埃可1～8、11～34型病毒引起可引起非特異性發熱。
10.其他
埃可4，9型病毒可引起肝炎，9型亦可引起睪丸炎；埃可4，9，16，20型病毒可引起淋巴結炎。
