眼病期多合并有廣泛性視網膜剝離，膜周圍出現小白斑，眼底色素萎縮、沉積，還可出現繼發性青光眼、白內障、視神經炎、眼球萎縮。腦神經麻痹。并發癥的發生與葡萄膜炎的持續時間、復發頻度有明顯的關系，炎癥持續時間越長，復發頻度越高，越易出現并發癥。此外，還與糖皮質激素的應用有關。長期的糖皮質激素滴眼劑點眼治療易引起糖皮質激素性青光眼和白內障。
伏格特-小柳-原田病最易引起的并發癥為并發性白內障、繼發性青光眼。此外，還可引起視網膜下新生血管膜、黃斑裂孔、增殖性視網膜病變等。一些學者將晚霞狀眼底改變也歸為并發癥之列。
并發性白內障
Vogt-小柳原田病的肉芽腫性前葡萄膜炎往往反復發作，易于引起虹膜后粘連，且此類患者血-房水屏障功能破壞非常顯著，房水成分的改變往往給晶狀體的代謝帶來不利影響，因此并發性白內障是一常見的并發癥。據報道其發生率為10.5%～40.4%。此病所致的并發性白內障，主要表現為晶狀體后囊下混濁、核性白內障、前皮質混濁等。
繼發性青光眼
繼發性青光眼是Vogt-小柳原田病的一個常見并發癥，其發生率為6%～45%。Vogt-小柳原田病引起的繼發性青光眼可見于葡萄膜炎發生后的任何時期，但多發生于前葡萄膜炎復發期，其發生與虹膜后粘連、瞳孔阻滯、房角閉塞、小梁網炎癥、炎癥細胞封閉小梁網及糖皮質激素長期應用等有關。此綜合征所致的青光眼多為虹膜完全后粘連或房角大部分或完全粘連所引起。一些虹膜完全后粘連的患者可伴有虹膜新生血管，此種新生血管在前后房得以交通和眼壓下降后可完全消失。
值得說明的是，少數Vogt-小柳原田病患者可發生急性閉角型青光眼，此種并發癥可發生于前驅期，也可與葡萄膜炎同時出現。一些患者以急性閉角型青光眼作為此綜合征的最初眼部表現，患者表現為眼壓突然升高或緩慢升高，前房變淺，也可伴有前房閃輝，或伴有脈絡膜炎、脈絡膜視網膜炎、視盤炎和神經視網膜炎。全身用糖皮質激素治療后，房角開放，推測睫狀體的急性炎癥水腫導致晶狀體虹膜隔前移，從而導致房角關閉，引起急性閉角型青光眼。此綜合征引起的眼壓升高可為短暫性的。
視網膜下新生血管膜和增殖性病變
視網膜下新生血管膜是Vogt-小柳原田病的一個相對少見的并發癥，主要發生于脈絡膜炎癥未能及時控制和反復發作的患者。其發生率為0.96%～36%，雖然它不如并發性白內障常見，但其引起的視功能損害要遠大于并發性白內障。Moorthy等對65例患者的130眼觀察發現，12例發生了視網膜下新生血管膜，平均發生時間為葡萄膜炎發生后14.5個月。對一些參數進行統計學分析發現，此種病變的發生與種族、性別、年齡等因素無關，但與慢性或反復發作的炎癥（P<0.001）、明顯的眼前段炎癥（P<0.01）和廣泛的視網膜色素上皮改變（P<0.05）有密切的關系。
視網膜下增殖膜呈白色膠質狀，活動期時可伴有因視網膜下出血而出現隆起。視網膜下新生血管膜多發生于視盤旁和黃斑區，也可發生于周邊部。視盤旁和黃斑區是視網膜下新生血管膜的好發區，其原因可能與此綜合征的炎癥病灶多發生于此部位有關。炎癥對Bruch膜和脈絡膜毛細血管的損傷可以導致脈絡膜和外層視網膜缺血，從而刺激脈絡膜毛細血管內皮細胞增殖，引起視網膜下新生血管膜的形成。下方周邊部也是炎癥病灶的多發部位，而報道的下方視網膜下新生血管膜并不常見，這可能與此部位隱蔽及出現的新生血管膜對視力影響不大，不被人們所注意等因素有關。
其他并發癥
部分患者出現耳聾及前庭性平衡障礙，少數可表現柯薩柯夫綜合征。皮膚可并發白癜風。
