口腔黏膜病除一些疾病的病因較明確外，較多種疾病的病因仍不清楚。
1.與隨著年齡增長，口腔免疫力下降的生理缺陷有關，成年人由于成長激素的分泌減少，口腔對于維生素的吸收能力反而不如兒童生長期。老年人身體容易出現胃腸功能紊亂，體內缺乏鐵、鋅等微量元素，睡眠不好導致精神緊張，勞累或感冒時，都會誘發口腔潰瘍。
2.復發性口腔潰瘍屬于多基因遺傳病，父母口腔潰瘍比較嚴重，子女遺傳幾率極大。
