常規做B超、X線片和腦CT等影像學檢查，常發現全身淋巴結腫大，發現肺部炎癥病變，發現明顯的中樞神經系統占位性病變等。
肺部感染是常見并發癥和死亡的主要原因，主要是PCP、LIP、細菌性肺炎和肺結核。PCP是嬰兒期艾滋病最常見的機會性感染，胸部X線攝片顯示初期在肺門周圍出現網狀、絮狀和條索狀糢糊陰影，隨著病情進展，出現小片狀模糊陰影和類結節狀陰影，亦可融合成較大的片狀陰影。類結節狀陰影常為多發性。肺部病變一般自兩肺門沿支氣管向外周發展，兩肺尖和肺底很少受累或受累較輕是本病特點。
LIP的早期可無癥狀，有雙側肺部陰影。雙肺紋理增多或網點狀陰影，肺底明顯呈羽毛狀，晚期為肺間質纖維化，呈蜂窩肺影。
中樞神經系統的感染可引起嚴重彌漫性或局灶性感染，引起腦病的臨床表現，如運動異常和痙攣，也引起神經根神經病和腦卒中。
