急性間質性腎炎的治療目標是去除病因、促進腎功能恢復以及防治并發癥。
病因治療針對引起急性間質性腎炎的不同病因進行相應的處理。對藥物過敏性AIN一旦臨床診斷確立，應立即停用可疑致病藥物。若無法確定致病藥物時，應及時停用所有的可疑藥物。對于其他原因引起的急性間質性腎炎，可針對不同的情況進行針對性的治療，如治療感染和治療原發病等。
同時應給予支持及對癥治療，維持水、電解質及酸堿平衡，以及加強營養支持，合理給予蛋白質、熱量、維生素等。
在AIN早中期，可給予腎上腺糖皮質激素治療。有關研究證實，4～6周的皮質激素治療可使藥物過敏性AIN患者的腎功能恢復加快，尤其是腎間質彌漫的炎癥細胞浸潤、腎功能急劇惡化者，或肉芽腫性間質性腎炎患者。一般可予口服潑尼松，疾病好轉即逐漸減量，大多數可以應用4～6周后停用，通常不超過3月。在腎間質病變嚴重、伴有肉芽腫且腎功能急劇惡化的情況下，可考慮靜脈給予甲基強的松龍進行沖擊治療。特發性AIN也是應用糖皮質激素治療的指征，激素治療不僅促進腎功能恢復、預防或減少腎間質纖維化，并可改善眼色素膜炎。
對嚴重急性腎衰竭（尤其是少尿型）具有透析治療指征時，應盡快給予血液凈化治療，一般為血液透析，個別特殊情況下可考慮連續腎替代治療（CRRT），以幫助病人渡過危險期。
