心臟移植后由于早期使用了大劑量免疫抑制劑，病人極與發生感染，術后1年內有10%的嚴重感染是致命的，感染所致病死率和由排斥反應所致的病死率近似。現行預防感染的主要措施是：
（1）加強術前受者和供者全面體檢。
（2）使病人處于保護性隔離狀態，室內嚴格消毒，醫務人員進入房間要戴口罩、帽子、穿無菌隔離衣，禁止無關人員進入監護室。
（3）護理工作中要嚴格無菌操作，控制感染途徑。
（4）連續作血、尿、痰及各種引流管周圍皮膚的拭子細菌培養，以監測可能的早期感染。
（5）藥物預防感染除了術后應用廣譜抗生素外，針對巨細胞病毒感染可給予更昔洛韋及免疫球蛋白。針對真菌感染可使用兩性霉素B、酮康唑或大蒜素。針對弓形體感染可給予乙胺嘧啶。
（6）一旦出現感染，早期若病原體難以確定且病情發展迅速，主張聯合用藥，即廣譜抗生系、抗病毒藥物、抗真菌藥物、抗原蟲藥物聯合應用，同時調整免疫抑制劑用量，加強支持治療。一旦病原體明確，應立即根據藥物敏感試驗進行調整。