致病性與免疫性人皰疹病毒6型在人群中的感染十分普遍。健康帶毒者是主要的傳染源，經唾液傳播，垂直傳播也時有發生。HHV-6原發感染后多無癥狀，少數可引起幼兒丘疹或嬰兒玫瑰疹。常急性發病，先有高熱（39℃數天）和上呼吸道感染癥狀，退熱后頸部和軀干出現淡紅色斑丘疹。此外，感染可導致中樞神經系統癥狀，包括癲癇、腦膜炎和大腦炎等。HHV-6很少引起成人原發感染。
HHV-6感染也是引起器官移植受者發熱的原因之一，在脊髓移植等免疫功能低下的病人，體內潛伏的HHV-6常可被激活而發展為持續的急性感染。淋巴增殖性疾病、自身免疫病和免疫缺陷病人均是HHV-6的易感宿主，隨著器官移植的發展和艾滋病病人的增多，HHV-6感染日益受到人們的關注。