已證明一般情況下馬來酸依那普利耐受性良好。在臨床研究中．馬來酸依那普利副作用的總發生率與安慰劑相似。大多數副作用均性質輕微而短暫。不須終止治療。
下述副作用與應用馬來酸依那普利片有關：
1．暈眩和頭痛是較常見的副作用。2%～3%的病人報告感覺疲乏和虛弱。少于2%的病人報告發生其它副作用，包括低血壓、直立性低血壓、暈厥、惡心、腹瀉、肌肉痙攣、皮疹和咳嗽、腎功能障礙．腎衰和少尿罕見。
2．過敏/血管神經性水腫
有報道在面部、四肢、唇、舌、聲門和，或喉部發生血管神經性水腫．但罕見(參閱注意事項)。
3．在臨床對照試驗中或藥物上市后發生的極罕見副作用有：
(1)心血管系統
心肌梗塞或腦血管意外，可能繼發于高危病人的血壓過低(參閱注意事項)。
胸痛；心悸；心律失常；心絞痛；雷諾現象。
(2)胃腸道系統
腸梗阻：胰腺炎：肝功能衰竭；肝炎一肝細胞性或膽汁郁積性：黃疸：腹痛：嘔吐；消化不良：便秘；厭食；胃炎。
(3)神經系統/精神方面
抑郁：精神錯亂：嗜睡；失眠；神經過敏：感覺異常：眩暈；異常夢。
(4)呼吸系統
肺浸潤：支氣管痙攣/哮喘：呼吸困難；流涕；咽痛和聲嘶。
(5)皮膚
多汗；多形性紅斑；剝脫性皮炎；Steven—Johnson綜合癥；毒性表皮壞死松懈；天皰瘡；瘙癢；蕁麻疹；禿發。
(6)其它
陽痿；潮紅；味覺改變；耳鳴：舌炎；視覺模糊。
曾報道一種具有部分或全部以下癥狀的癥候群：發熱、漿膜炎、血管炎、肌痛/肌炎、關節痛/關節炎、抗核抗體陽性、血沉增快、嗜酸性粒細胞增多和白細胞增多，也可出現皮疹．光過敏及其它皮膚病的表現。