吸收-氟西汀口服吸收良好。進食不會影響藥物的生物利用度。
分布-氟西汀與血漿蛋白大量結合（約95%），分布廣泛（分布容積20~40L/kg）。服藥數周后達到穩態血漿濃度。連續服藥后的穩態血漿濃度同服藥4~5周相似。
代謝-氟西汀符合有肝臟首過效應的非線性的藥代動力學特性。服藥后6到8個小時達到血漿峰濃度。氟西汀主要經CYP2D6酶的代謝。氟西汀主要通過肝臟代謝，通過去甲基化作用生成活性代謝產物去甲氟西汀(demethylfluoxetine)。
清除-氟西汀的消除半衰期為4~6天，而去甲氟西汀為4~16天。較長的半衰期使得停藥后仍能維持5到6周的療效。本品主要(大約60%)經腎臟排泄。氟西汀可以分泌至母乳。
高危人群
老年人：與較年輕的患者比較，健康老年人的動力學參數沒有改變。
肝功能不全：由于肝功能不全（酒精性肝硬化），氟西汀和去甲氟西汀的半衰期分別增加至7天和12天。應該考慮給予較低的劑量或降低給藥頻率。
腎功能不全：給予輕度、中度和完全腎功能不全（無尿）的患者單一劑量的氟西汀后，動力學參數與健康志愿者相比無差異。重復給藥后，觀察到穩態血漿濃度的增加。