大約90000名12歲以上過敏性鼻炎患者參加的隨機對照臨床試驗中，口服氯雷他定10mg，每天一次，連續用藥2周至6個月，用藥組和安慰劑組因不良反應停藥者發生率2%。
本品的副作用不隨年齡、性別、種族的不同而不同，除了上述發生率大于2%的不良反應以外，還發現以下不良反應（發生率小于2%）：
1、一般表現：血管神經性水腫、虛弱、背痛、視物模糊、胸痛、耳痛、眼痛、腿部抽筋、寒顫、耳鳴、體重增加。
2、自主神經系統：流淚、流涎、潮紅、感覺遲鈍、陽萎、多汗。
3、心血管系統：高血壓、低血壓、心悸、室上性快速性心律失常、暈厥、心動過速。
4、中樞和外周神經系統：眼瞼痙攣、眩暈、感覺異常、震顫。
5、消化系統：消化不良、胃脹、味覺改變、食欲下降、便秘、腹瀉、呃逆、食欲增加、惡心、胃炎、牙痛、嘔吐。
6、運動系統：關節痛、肌痛。
7、精神神經系統：激動、健忘、焦慮、精神錯亂、性欲下降、注意力不集中、失眠、易怒、抑郁。
8、生殖系統：乳房痛、痛經、月經過多、陰道炎。
9、呼吸系統：支氣管炎、支氣管痙攣、咳嗽、呼吸困難、鼻出血、咯血、喉炎、鼻干、咽炎、鼻竇炎、噴嚏。
10、皮膚及附屬器：皮炎、毛發干燥、皮膚干燥、光敏反應、瘙癢癥、紫癜、皮疹、風疹。
11、泌尿系統：尿頻、尿液外觀顏色改變、尿失禁、尿潴留。
12、服用本品還可偶發肝功能異常（包括黃疸、肝炎和肝壞死）、禿發、過敏反應、乳腺增生、多形性紅斑、周圍性水腫、癲癇。