番木瓜(Carica papaya)又稱木瓜,是十字花目番木瓜科水果。番木瓜不僅可以作為水果食用,還有重要的藥用價值。作為一種重要的熱帶植物,番木瓜的產量和質量常常受到病蟲害的嚴重影響。其中為害最普遍及最嚴重的首推由病毒引起的番木瓜環斑花葉病,除此之外,還有10多種真菌病害,如炭疽病、葉斑病。為了減少損失,目前已經培育了抗特異類型病毒的轉基因番木瓜品種。盡管如此,單一的轉基因品種仍然無法抵御其他病害的威脅。為了更好從分子水平研究番木瓜,南開大學和美國的研究機構進行的一項大型聯合研究,于2008年獲得了番木瓜基因組的首個草圖。這個草圖拼出了90%的番木瓜基因編碼序列。
miRNA是一類21個核苷酸左右的小分子,它可以直接負調控其靶基因的表達。研究表明,植物miRNA參與了生長發育,營養代謝,生物和非生物逆境等多方面的功能。結合已有的小RNA深度測序結果于基因組序列,利用生物信息學技術手段,中科院西雙版納熱帶植物園植物分子研究組鑒定了75個保守的miRNA和11個新的miRNA,并預測了這些miRNA對應的靶基因。這些miRNA直接調控植物生長發育和抗逆等方面的關鍵基因。同時,該研究還鑒定了幾個番木瓜特有的miRNA調控途徑,這些途徑可能直接參與番木瓜的抗病功能。
該研究以Identification of miRNAs and miRNA?mediated regulatory pathways in Carica papaya為題發表在Planta上。
該項目得到了西部之光和135工程的資助。
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非編碼RNA中的miRNA和tRNA在基因表達調控中扮演重要角色,然而在棘皮動物中相關研究非常缺乏。近日,記者從中科院海洋所了解到,該所實驗海洋生物學重點實驗室研究員李富花課題組通過多組學數據整合分析......
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