中國科學家Nature子刊公布新基因組草圖

　　來自合肥工業大學、四川大學、四川省自然資源科學研究院、北京百邁客生物科技有限公司等10多家機構的研究人員組成的一個研究小組成功繪制出了獼猴桃(Actinidia chinensis)的全基因組序列草圖。相關成果發表在10月18日的《自然通訊》(Nature Communications)雜志上。

　　合肥工業大學生物與食品工程學院的劉永勝(Yongsheng Liu)教授，美國康奈爾大學費章君(Zhangjun Fei)博士以及北京百邁客生物科技有限公司的鄭洪坤(Hongkun Zheng)是這篇論文的共同通訊作者。

　　獼猴桃科是杜鵑花目的基礎一科，有獼猴桃屬、水東哥屬和藤山柳屬等。獼猴桃屬包括有幾種具重要經濟價值的園藝品種，例如中華獼猴桃、美味獼猴桃、軟棗獼猴桃和毛花獼猴桃等。在獼猴桃屬中大約有54個物種和75個分類群，所有這些都是多年生、落葉、雌雄異株植物，具有攀緣或蔓生生長習性。

　　由于其維生素C含量極高，且具有均衡的礦物質、膳食纖維和其他有益健康的代謝產物營養成分，長期以來獼猴桃被稱作“水果之王”。廣泛的研究報道在獼猴桃中有維生素C、類胡蘿卜素和黃酮類化合物的代謝累積。獼猴桃的起源中心是在中國西南部的山區，其馴化史較短，它的種子到20世紀早期才開始被引入到新西蘭。通過幾十年的馴化，以及付諸極大的努力對野生獼猴桃進行選擇已開發出了許多的品種。獼猴桃現已成為了世界上重要的一種新鮮水果，2011年年產量達到144萬噸。

　　盡管已存在有一個廣泛表達序列標簽(EST)數據庫和幾個遺傳圖譜，獼猴桃全基因組序列資源仍然非常有限，而這對于育種及品種改良至關重要。獼猴桃屬于杜鵑花目。當前，只有番茄和馬鈴薯等茄科物種基因組進行過測序，還沒有杜鵑花目的物種進行基因組測序的報道。

　　在這篇文章中，研究人員對在中國廣泛種植的一種雜合獼猴桃：紅陽獼猴桃(Hongyang)進行了基因組測序及分析，組裝出了全長為616.1? Mb，包含39,040個基因的基因組。比較基因組分析結果揭示，獼猴桃經歷了一次為核心真雙子葉植物所共享的遠古六倍化(hexaploidization)事件，以及兩次較近的全基因組復制事件。兩次近期的復制事件均發生在獼猴桃與番茄及馬鈴薯分歧后，促成了調控如維生素C、類黃酮和類胡蘿卜素代謝等獼猴桃重要特性的基因產生新的功能。

　　作為第一個杜鵑花目的測序物種，這一獼猴桃基因組序列不僅提供了有關獼猴桃特異性、重要農藝性狀的分子基礎的一些新認識，有助于推動作物改良，并為更深入地進行進化和比較基因組學分析提供了一個寶貴的資源。