上海巴斯德所等在新型H7N9病毒起源研究中獲進展

　　3月12日，國際學術期刊Journal of Virology在線發表了中國科學院上海巴斯德研究所病原診斷技術研發中心與浙江省湖州市疾病預防控制中心合作的研究論文Co-circulation of three HA and two NA subtypes of avian influenza viruses in Huzhou, China, April 2013: implication for the origin of the novel H7N9 virus。(《2013年4月湖州出現3個HA和2個NA流感亞型共流行：提示新型H7N9病毒的起源》)

　　2013年2月開始，我國長三角地區爆發了由新型H7N9禽流感病毒感染人類導致的嚴重疫情。湖州市位于浙江省北部，地處長三角腹地，與江蘇、安徽省接壤，緊鄰上海，是H7N9疫情的重災區之一(圖1)。應湖州市疾病預防控制中心的邀請，上海巴斯德所副所長藍柯帶領由冷啟彬、周東明、張馳宇研究員以及王莉莉、劉嘉等技術人員組成的研究團隊，赴湖州開展合作研究。

　　進化時間動力學分析顯示，新型H7N9禽流感病毒的NA基因起源時間早于HA基因，表明H7N9的起源可能至少牽涉2次不同的重排事件：第一次重排事件使N9型NA基因整合到H9N2的基因組形成H7N9的進化中間體H9N9病毒，H7型HA基因通過第二次重排事件整合到H9N9的基因組形成H7N9(圖2)。通過對湖州2013年4月采集的禽類樣品(糞便，污水等)進行流感基因片段擴增、測序和進化分析，發現禽類中存在H7，H9，H5三個HA基因型的共流行以及N9和N2兩個NA基因型的共流行。一株H9N2病毒A/Chicken/Huzhou/C143/2013(H9N2)在流感6個內部基因片段的進化分析中，總是緊密地聚類在新型H7N9形成的進化簇(cluster)的外側，表明A/Chicken/Huzhou/C143/2013(H9N2)是遺傳上與新型H7N9最相關的H9N2流感病毒株。此外，研究還發現了2株疑似H9N9毒株。湖州北鄰我國第三大淡水湖-太湖，擁有2個天然的野鳥棲息地，具備H7N9起源的環境條件，研究結果提示湖州是新型H7N9的起源地之一。

　　研究結果發表前，研究團隊描述了湖州出現的第一例H7N9確診死亡病例的臨床特征(Emerg Microbes Infect. 2013, 2:e23)，對湖州所有H7N9確診病例進行了系統的流行病學研究，并檢測了H7N9病毒在夏季極高氣溫下的流行狀況。研究發現確診病人均有與禽類接觸或暴露史，進一步證明禽類是新型H7N9的直接來源(Euro Surveill. 2013;18(20):pii=20481);新型H7N9病毒對高溫具有很強的適應性，表明湖州是H7N9的重要傳播源(Int J Infect Dis, in press)。

　　該項合作研究為湖州的疾病防控提供了重要的參考依據，是上海巴斯德所利用自身研究優勢支撐地方疾病防控的成功案例。該研究在藍柯、張馳宇、周東明、冷啟彬等研究員以及湖州疾病預防控制中心主任韓健康的合作指導下完成，得到了國家科技重大專項及李嘉誠基金會的支持。

圖1. 2013年春季湖州市確診病例和活禽市場分布

圖2. 新型H7N9病毒各基因起源的時間動力學(A)和重排起源模型(B)