中國科學院大連化學物理研究所 葉明亮研究員
2014年4月26日，首屆全國質譜分析學術研討會在北京西郊賓館盛大開幕。來自中國科學院大連化學物理研究所的葉明亮研究員為大家帶來題為《蛋白質組修飾譜分析新方法》的報告。翻譯后修飾大多發生在具有重要生理調控功能的低豐度蛋白質分子上，其分析鑒定面臨諸多技術上的挑戰。為此葉明亮研究員課題組發展了多種蛋白質組修飾譜分析的新技術新方法。葉明亮研究員就修飾蛋白質組學的快速分析、規模化分析、精致分析和底物篩選四個方面所做的工作進行了介紹。
一、快速分析
為了實現樣品預處理步驟的優化與集成化，建立了超快磷酸化蛋白質組樣品的處理方法，該方法只需25分鐘即可完成富集，相對于傳統方法的16個小時，大大節省了工作時間。據葉研究員介紹，他們是通過使用高濃度的胰蛋白酶和使用高特異性的富集方法來實現的。
二、規模化分析
通過結合多酶酶切策略，親水作用色譜和酰肼化學兩種富集方法建立了一種用于復雜生物樣品中N-糖基化蛋白質組的大規模鑒定系統，很大程度上提高了糖基化蛋白質組的蛋白覆蓋率。葉研究員課題組將該系統用于人肝樣品中N-糖基化蛋白質的鑒定，共鑒定到了14498條N-糖基化肽段，對應2210個糖基化蛋白質和4793個N-糖基化位點。這是迄今為止數目最大的人源糖基化蛋白質組數據集。
三、精致分析
通過特異性的化學反應與內切糖苷酶酶切，實現了對糖鏈結構上同時含有末端唾液酸和核心巖藻糖糖基化位點的富集，使得高通量的異常糖基化質譜分析成為可能。
四、底物篩選
為了通量化篩選激酶底物，建立了一種高通量的整合的激酶底物篩選磷酸化蛋白質組平臺，并成功的應用于CK2激酶底物的篩選。
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