mBio：宏基因組學揭示700年前男性骨架中的布魯氏菌感染

　　華威大學的研究人員和意大利人類學家Raffaella Bianucci一起，從意大利一個中世紀村莊的廢墟中找到了一個700年的人類骨架，并且從中分離出了致病性細菌——布魯氏菌，獲得了其全部基因組信息。

　　布魯氏菌是能夠引發人畜共患病的一種致命細菌，通常是從未經高溫消毒的奶制品或者直接接觸感染的動物體中獲得，病癥包括高燒、關節炎、心肝腫大等。布魯氏病現在仍舊會放生在地中海地域。

　　這項研究成果于本周發表在了mBio、美國微生物學會在線期刊上，華威大學醫學院教授Mark Pallen和他的同事利用一個稱作鳥槍法宏基因組學的技術來測定這個男性盆骨位置一個已鈣化結節的DNA序列。這個技術無需尋找一個特殊的靶點，而是從樣本中檢測 DNA 序列的技術，并且樣本不需要培養或擴增。這種方法避免了與細菌培養或 DNA 擴增相關的復雜性和不可靠性。

　　“通常來說，人類和動物身體的鈣化原因是肺結核，它也是最常見的導致鈣化的感染病”，Pallen教授說，“因此當我們確認是布魯氏菌感染時，也十分驚訝”。

　　這個骨架的盆骨區域有32個硬幣大小的發硬的結節，但是Pallen說，這個結節是否是致病源頭仍不清楚。

　　在試驗中，研究團隊還發現了碎片中提取的DNA具有古時DNA的特征，它們比現在的DNA更短，并且具有典型的末端突變。他們發現此次分離的中世紀布魯氏菌菌株和1961年意大利發現的布魯氏菌菌株Ether，以及2006、2007年意大利發現的另外兩株布魯氏菌菌株十分相似。

　　Pallen和其他人在之前就已經用過鳥槍法基因組學技術來檢測古代和現代的人體物質中的病原體。去年夏天，他們就在《英格蘭醫學雜志》上發表了一篇報道，闡述了他們從一具來自匈牙利的215年之久的女性木乃伊肺組織中獲得了肺結核基因組。2011年，他們在還利用此技術鑒定了德國的一場大腸桿菌爆發的源頭菌株。

　　Pallen的團隊現在正在測試這項技術是否成功應用于其它一系列種類的樣品中，例如匈牙利木乃伊、埃及木乃伊、16至17世紀的韓國木乃伊、以及5至8世紀梅羅紋加王朝法國女王的肺組織，以及岡比亞的古代痰液樣本。

　　Pallen 說：“宏基金組學技術已經做好了充分的準備，來記錄從古至今的感染性疾病，脫去病原微生物出現、進化以及傳播的神秘外衣。我們希望利用這項技術來發現更多新的事物。”