福建出入境檢驗檢疫局檢驗檢疫技術中心是原國家出入境檢驗檢疫局于1999年批準設立的獨立事業法人單位，隸屬于福建出入境檢驗檢疫局。
檢驗檢疫技術中心的歷史可以追溯到上世紀五十年代初。原福州商檢局成立不久，就先后組建了農食畜實驗室和化礦實驗室。經過不斷地快速發展，到了八十年代，福建商檢局農食畜實驗室和化礦實驗室已成為當時商檢系統內頗有影響的檢測機構。到了九十年代初，福建商檢局又組建了機電實驗室，三個實驗室先后獲得原國家商檢系統二級實驗室認證證書。1997年11月，技術中心前身原福建商檢局綜合檢測中心成立，其下屬化礦金實驗室、農食畜產品實驗室、輕紡實驗室和工業及信息產品電氣安全實驗室先后獲得CCIBLC認可證書。1999年“三檢合一”以后，福建出入境檢驗檢疫局在福建商檢局綜合檢測中心基礎上，組建了檢驗檢疫技術中心，增加了植物檢疫、動物檢疫等專業，共有7個專業實驗室，檢測(疫)范圍進一步擴大。2003年1月，技術中心以一個整體，通過了CNAL認可和計量證書“二合一”評審(認可證號：L0473;計量證書號：(2003)量認(Z2233)號)。
檢驗檢疫技術中心本部由三個檢測所和科研開發所、綜合事務所、業務開發所等六個職能部門組成。三個檢測所分別是食品所、動植所和工礦所，下轄九個直屬實驗室。目前，技術中心對分支機構的九個專業實驗室實行“垂直體制，雙重管理”，這些下屬實驗室也分別為CNAL認可和/或國家認監委注冊、計量認證實驗室。 檢驗檢疫技術中心直屬實驗室現有在編人員140人，其中高級職稱人員35人，中級職稱人員32人;29 人具有碩士學位，9人具有博士學位;中心現有人員中有6人通過ISO/IEC17025標準培訓合格，成為CNAL實驗室評審員。
檢驗檢疫技術中心歷來注重自身的工作質量。為了滿足自身、委托方和社會的需求和期望，建立健全管理體系。管理體系滿足ISO/IEC17025《測試和校準實驗室能力的通用要求》的要求，并在運行中持續改進，不斷完善管理體系。檢驗檢疫技術中心在獲得認可證書和計量合格證書的基礎上，成為國家認監委指定的強制性產品認證(CCC)檢測實驗室，是國家質檢總局燈具、插頭插座、小家電、收錄音機、偶氮染料、電池汞含量、進口涂料和動物源性飼料中牛羊源性成分等專項檢測指定實驗室，中國質量認證中心生態紡織品認證檢測指定實驗室，同時還是韓國食品藥品管理廳(KFDA)認定“國外公認檢測機構”，法國生物梅里埃公司指定示范實驗室和德國萊茵TUV公司簽約實驗室。
檢驗檢疫技術中心自2000年底以來，在福建局黨組的直接指導下，進行了“垂直體制，雙重管理”的實驗室運行機制改革。改革的目的是：最大限度地發揮省局技術中心直屬實驗室對轄區下屬實驗室的專業技術業務指導作用，發揮技術中心整體的資源配置作用，有所為有所不為，避免實驗室小而全、大而全的弊病，合理利用實驗室現有資源，根據各地區特點，建設有當地出入境物品(商品)特色的實驗室，充分發揮福建局技術中心系統實驗室的整體優勢。
按照質檢總局的實驗室建設規劃，技術中心將有國家鞋類檢測中心等八 個實驗室成為國家級重點實驗室。技術中心計劃通過加強國家級重點實驗室建設，進一步把工作重點轉移到安全、衛生、健康、環保、反欺詐等的檢測項目上，進一步拓展檢驗檢疫檢測新領域，開驗新項目，適應檢驗檢疫模式的轉變，強化涉外經濟執法功能，打破或建立技術性貿易壁壘。同時深化和完善對下屬實驗室的“垂直體制，雙重管理”，使技術中心實驗室的第一生產力作用發揮出更大的潛力，為福建局出入境檢驗檢疫局的行政執法、為福建省的外貿進出口和出入境安全提供更多、更大、更有力的技術保障功能。
福建出入境檢驗檢疫局檢驗檢疫技術中心是中國質量認證中心生態紡織品認證檢測指定實驗室，同時還是韓國食品藥品管理廳(KFDA)認定“國外公認檢測機構”，動植所分子生物學實驗室是檢驗檢疫系統首批25個獲得轉基因成分定性檢測資格的實驗室之一。
福建出入境檢驗檢疫局檢驗檢疫技術中心
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