溶酶體(lysosome /?la?s??so?m/)是一種在很多動物細胞中發現的膜結合細胞器。它們是球形囊泡，含有的水解酶可以分解多種生物分子。溶酶體的膜蛋白和內腔蛋白都有特定的組成。內腔水解酶最適的pH約為4.5–5.0，類似于胃的活動。除了降解聚合物，溶酶體還參與各種細胞過程，包括分泌、質膜修復、細胞信號轉導和能量代謝。
溶酶體作為細胞的廢物處理系統，從細胞內外消化著細胞質中廢棄或未被利用的物質。細胞外的物質通過內吞作用被吸收，而細胞內的物質通過自噬作用被消化。細胞器的大小差異很大——較大的細胞器可能是較小細胞器的10倍以上。它們是由比利時生物學家克里斯汀·德·迪夫發現并命名的，他最終獲得了1974年諾貝爾生理醫學獎。
溶酶體已知含有60多種不同的酶，有50多種膜蛋白。溶酶體的酶在粗面內質網中合成。酶是從高爾基體的小囊泡中導入的，而小囊泡是與較大的酸性囊泡融合。溶酶體固有的酶被分子甘露糖6-磷酸特異性標記，因此它們能被正確地分類到酸化囊泡中。
溶酶體酶的合成由核基因控制。這些酶的基因突變導致了30多種不同的人類遺傳疾病，這些疾病統稱為溶酶體貯積癥。這些疾病是由于特定底物無法被分解而累積所導致的。這些遺傳缺陷與幾種神經退行性疾病、癌癥、心血管疾病和衰老相關疾病有關。