上海交大MCP最新成果：首個全覆蓋登革病毒蛋白質芯片

　　作為RNA病毒中的一種，登革病毒每年感染數千萬人，其遺傳信息高度可變，目前缺乏有效的疫苗、藥物及研究工具。近期來自上海交通大學系統生物醫學研究院，廣東省CDC病原微生物研究所的研究人員發表了題為“Rapid production of virus protein microarray using Protein microArray fabrication through GEne Synthesis (PAGES)”的文章，報道了全球第一款全覆蓋登革病毒蛋白質芯片。

　　這一研究成果公布在12月13日的國際蛋白質組學領域權威期刊Molecular & Cellular Proteomics (MCP)雜志上。文章的通訊作者是上海交通大學系統生物醫學研究院陶生策研究員。陶生策研究員主要研究方向為蛋白質芯片的構建和應用研究、系統生物序高通量技術研發以及蛋白質翻譯后修飾（糖基化，乙酰化），獲得過多項ZL授權。

　　系統地了解病毒的生物學特性，尤其是免疫原性等，是有效診斷病毒性傳染病和新疫苗研制的關鍵，但是目前傳統蛋白質芯片構建技術具有構建周期長、嚴重依賴天然模板、無法應對高變異序列等不足。

　　在這篇文章中，研究人員以登革病毒為模板，通過一系列的生物信息學分析，對已公開發表的3000多條登革病毒蛋白氨基酸序列開展聚類分析，獲得每一血清型的共有序列，轉換成對應的基因序列，并進行序列優化后，最終獲得所有蛋白質對應的基因序列。采用基因合成的方式，快速獲得遺傳材料及表達克隆，進行異源表達，高效獲得大量可溶性的目標蛋白質，實現蛋白質芯片的快速制備。

　　并且研究人員還通過篩選I型登革病毒感染患者和正常個體血清，發現了蛋白質I-E和III-E是區分兩者最有潛力的標識物。隨后，他們進一步使用ELISA進行驗證。而且利用所構建的登革病毒蛋白質組芯片還篩選了II型、III型登革病毒感染患者，恙蟲感染患者，乙腦感染患者和出血熱患者血清中針對不同登革病毒抗原的抗體含量。從中研究人員分析了I型登革病毒感染患者血清中抗體隨時間的變化規律。

　　這項研究中研發的快速蛋白質芯片構建技術具有通用性、無需接觸傳染源等，將為系列重要RNA病毒和其它相關蛋白質芯片的構建鋪平道路。