中樞神經系統腫瘤快速分類新技術

　　荷蘭科學家研究報道了一種給中樞神經系統腫瘤快速分類的技術，結合快速測序和深度學習AI模型，或能在不到90分鐘內完成分子診斷。相關研究近日在線發表于《自然》。研究結果顯示術中進行腫瘤分子診斷以輔助手術決策的潛在可行性。

　　中樞神經系統腫瘤的主要治療方式包括通過手術摘除腫瘤，這要求在經過謹慎考慮后，在清除腫瘤組織的同時最大程度降低神經系統損傷等并發癥的風險。目前的標準流程依賴術前成像和術中組織學分析，但這些方法有時無法給出最終結論，偶爾也不準確。通過DNA測序獲得甲基化圖譜或揭示關于腫瘤起源和預后的信息，但一般要好幾天才能出結果。

　　為了快速獲得DNA甲基化圖譜，從而實現術中診斷，Jeroen de Ridder和同事使用了納米孔測序技術。該技術速度更快，但產生數據覆蓋的遺傳位點不如傳統測序技術多。為了在這么少的數據下實現中樞神經系統腫瘤的分子分類，研究團隊開發了名為“Sturgeon”的神經網絡工具。

　　在用模擬數據對該工具進行訓練和校準后，作者用中樞神經系統腫瘤樣本的數據測試了Sturgeon。該工具基于相當于測序20~40分鐘的數據對50個樣本中的45個進行了正確分類。作者還在25次手術期間測試了Sturgeon的表現，發現它能給72%的腫瘤準確分類，且給出診斷報告的時間不超過90分鐘。

　　研究結果表明，基于快速測序的術中深度學習診斷或能輔助神經手術決策并有望改善患者預后。