BioMarkHD高通量數字PCR基因分析系統

BioMark HD高通量數字PCR基因分析系統
FLUIDIGM CORPORATION
富魯達

BioMark HD基因分析系統為高通量熒光定量PCR建立了新的標準。該系統整合先進的微流控芯片和qPCR技術，采用動態芯片（Dynamic Array?）/數碼芯片（Digital Array?）和實時熒光信號檢測系統為客戶提供芯片的高通量和qPCR的準確性。BioMark HD 系統能給研究人員提供高通量和靈敏度低至單細胞水平研究的微流控芯片實時熒光定量PCR系統。

BioMark HD基因分析系統 系統優勢
? 實時熒光定量和終點PCR兩種檢測模式最大化該平臺的靈活性
? 平臺開放，能與實驗時現行的Assay兼容，增加實驗靈活性
? 強大的，用戶友好的Biomark分析軟件使高通量SNP基因分型，基因表達定量和數碼PCR數據分析更精簡實用

BioMark HD基因分析系統 應用：
Single cell gene expression profile(單細胞基因表達定量圖譜) 
Digital PCR（數碼PCR）
Absolute quantitation for GMO test using Digital PCR(用數碼PCR進行GMO檢測絕對定量)
High Through-put Gene Expression(高通量基因表達定量)
High Through-put Genotyping (高通量基因分型)
Ultra-sensitivity mutation detection(超高靈敏度突變檢測)
Copy number variation(拷貝數變異研究)

BioMark HD基因分析系統 主要特性：
一個高通量SNP基因分型和數碼PCR的經濟解決方案
無與倫比的數據準確度和SNP call rate
模塊化系統設計使平臺更具擴展性
強大易用的數據分析軟件

BioMark HD基因分析系統 工作流程：
    移液——>上樣——>運行——>分析

增加您的信心
只需要10皮克的起始實驗材料——即可對群體或者單細胞進行表達譜分析
最優秀的重復性——芯片內和芯片間數據結果相關性為0.99
增加發現的可能——對單個細胞進行數百個基因進行高靈敏度表達譜研究

節約時間和成本
大量增加反應通量——30分鐘內可進行9，216個qPCR反應
較少錯誤——在不使用移液機械的情況下，減少99%的移液錯誤
利用最少的自愿得到最多的數據——通量更高，每個數據的成本降低10倍

擴展您的實驗能力
更靈活——可根據研究需要輕易改變實驗樣本和試劑的組合和配置
兼容各種試劑——可以使用各種商品化試劑和DNA結合染料
擴展您的實驗設計——比以前的傳統平臺運行更多的樣本和試劑

節約時間——減少99%的人工移液操作
減少認為錯誤——不需要昂貴的移液機器
節省成本——納升級的反應體系，節約試劑和樣本
無污染——完全密閉的反應倉體系
混合精準——微流體管道進行納升級的反應體系分液
3小時內獲得數據——多大9.216反應數據點
高度精準——利用離分辨率CCD檢測熒光信號
可調整芯片的設定——開放平臺
校正——△C1 △△C1和倍數變化計算
加速分析——自動閥值設定
下游軟件兼容性——數據可用 csv格式導出

Introduced in 2006 and updated in 2011, Biomark HD stands alone in the world of analytical instrumentation as a multiapplication platform without compromise, providing high quality results for every experimental approach. Using a wide variety of sample types and chemistry choices to accommodate the most genomic applications, Biomark HD lets users run entire projects from research to validation to routine screening on a single system with the flexibility and consistency necessary for today’s biological research.

Browse our catalog of related publications to learn how Biomark empowers researchers across a range of genomic fields.

只需10皮克的起始實驗材料--即可對群體或者單細胞進行表達譜分析

zei優秀的重復性--芯片內和芯片間數據結果相關性為0.99

增加發現的可能--對單個細胞進行數百個基因超高靈敏度表達譜研究

大量增加反應通量--30分鐘內可以進行9216個qPCR反應

減少錯誤--在不使用移液機械的情況下，減少99%的移液錯誤

利用zei少的資源得到zei多的數據--通量更高，每個數據的成本降低10倍

更靈活--可根據研究需要輕易改變實驗樣本和試劑的組合和配置

兼容各種試劑--可以使用各種商品化試劑和DNA結合染料

擴展您的實驗設計--比以前的傳統平臺運行更多的樣本和試劑

Instrument (Part Number BMKHD-BMKHD)

Dimensions
Depth	75 cm (29.5 in)
Width	75 cm (29.5 in)
Height	100 cm (39.4 in)
Weight	140 kg (308 lb)
Thermal Control	Peltier-based, 4–99 oC
Heating ramp rate	Up to 5.5 oC/sec
Cooling ramp rate	Up to 5.5 oC/sec
Detection	CCD camera; 9M pixel, 12 μm x 12 μm pixel size
Fluorescence excitation	475 nm, 530 nm, 575 nm
Fluorescence emission	525 nm, 570 nm, 630 nm
Power requirements	100–230 VAC, 50/60 Hz, 300 W Fluidigm provides a region-specific power cord for the Biomark HD system.
Instrument Control Computer
Computation	Intel? Core? i3-2120, 3.30 GHz
Memory	2GB
Storage	500 GB HDD
Ports	4 USB 1GB/sec Ethernet
Operating System	Microsoft? Windows? Professional Embedded 7
Monitor	LCD flat panel
Accessories	Keyboard and mouse

Work Environment (indoor use only)

Temperature	15–30 oC (59–86 oF)
Humidity	20%–80% relative humidity, non-condensing
Altitude	Not to exceed 2,000 m (6,560 ft) above sea level

Supported IFCs

Gene expression	48.48 Dynamic Array? IFC 96.96 Dynamic Array IFC 192.24 Gene Expression IFC Flex Six? Gene Expression IFC
Genotyping	48.48 Dynamic Array IFC 96.96 Dynamic Array IFC 192.24 Genotyping IFC Flex Six Genotyping IFC
Digital PCR	qdPCR 37K? IFC 48.770 Digital Array? IFC 12.765 Digital Array IFC

Software

Data Collection	Biomark HD Data Collection software
Analysis	Real-Time PCR Analysis software SNP Genotyping Analysis software Digital PCR Analysis software Melt Curve Analysis software

參考招標參數：廣州醫科大學采購廣醫三院高水平大學建設項目(三)（0809-1741GZG12314）

分包3：單細胞高通量基因表達系統

 (一)主要功能及組成 ：

1、系統功能：高通量單細胞基因表達定量圖譜（含RNA與microRNA），高通量SNP基因分型，實時熒光數碼PCR，拷貝數變異（CNV），可擴展用于特定基因區段捕獲用于高通量測序。

2、微流控芯片

3、微流控芯片自動上樣器

4、超高通量基因分析系統主機

5、配套軟件：

1) 高通量數據收集軟件，可同時收集動態芯片和數碼芯片實驗數據

2) 高通量基因表達定量分析軟件

3) 高通量基因分型分析軟件

4) 數碼PCR分析軟件

(二)、技術指標

1、★單張表達譜qPCR芯片通量 〉9,000實時熒光PCR數據點

2、★所有芯片建立qPCR時采用微流控技術自動上樣，檢測樣本和定量PCR試劑在密閉反應倉中自動混合，減少污染。

3、★平臺試劑開放,所有芯片或者耗材為非預先訂制芯片或者耗材，表達譜實驗可靈活更換實驗試劑和檢測基因的種類。

4、★兼容SYBRgreen, EvaGreen, TaqMan, Roche UPL等常見熒光定量PCR試劑

5、SNP分型call rate>99%,準確率〉99.75%

6、溫控：半導體制冷，4oC - 99oC，升溫：≥2oC/sec，降溫：≥1oC/sec；

7、檢測器：半導體制冷 CCD,900萬像素，像素大小12μm

8、內置條形碼閱讀器，自動記錄追蹤芯片條形碼

9、★qPCR表達譜芯片反應倉體積 ≤10 nl

10、數據輸出格式：CSV格式；

11、操作軟件自帶預設的PCR反應程序，也可根據需求更改熱循環條件；

12、基因表達分析軟件可自動計算基因表達變化，提供數據列表及熱圖等多種展示形式；

13、SNP分析軟件可根據實驗結果自動完成樣本的基因分型，無需進行復雜的參數設置；

(三)、應用性指標

1、多種格式芯片耗材靈活可選。

2、必須提供單細胞基因表達定量圖譜（含mRNA與micro RNA）官方實驗流程指引，包含詳細的硬件上機操作流程和所需的試劑。

3、 提供自己配套的單細胞多樣本多基因qPCR表達譜生物信息學分析工具。

4、 提供EvaGreen染料法高通量單細胞基因表達定量試劑及SNPtype_Assays定制設計服務.

（四）、售后服務

1、所提供的貨物（包括主機、配件和耗材）是全新的，未使用的，是zei新的版本型號，完全符合合同規定的質量和規格要求。

2、產品送到用戶所在地后，在接到用戶通知后兩周內完成安裝調試。

3、在用戶所在地對用戶進行相關培訓，培訓內容包括：儀器的技術原理、操作、數據處理、基本維護等。

4、提供壹年的整機免費保修。“