賽默飛基于其超高分辨的靜電場軌道阱(Orbitrap)質譜平臺結合其功能強大的軟件平臺,提供代謝組學全流程解決方案。該方案不僅覆蓋從極性代謝物到非極性代謝物的全面檢測、峰提取與定量、統計學分析與可視化作圖、代謝產物的全面鑒定、代謝通路分析等全流程的要求,而且還整合了從非靶標生物標記物發現到靶標生物標記物驗證的代謝組學不同層次的分析需求。
代謝組學全流程工作流程
卓越的硬件方案
賽默飛的 Orbitrap 技術作為近 30 年來全新的一種質譜技術,其超高的分辨率、卓越的質量精度、優異的靈敏度、極佳的穩定性及與 QQQ 媲美的定量能力使其可以全面地迎接代謝組學的挑戰,成為代謝組學研究強大的分析平臺。
一、超高的分辨率
消除復雜基質的干擾,全面的檢測代謝組 代謝組學分析的樣品基質復雜,且需要在有限的分析時間內盡可能實現全組分的同時檢測,而超高的分辨率對于分析那些基質復雜,干擾大的樣品尤為重要。
提供當前代謝組學前沿的研究領域代謝流組(Fluxomics)對于分辨率的超高需求 代謝流組通過對體內代謝物的標記,來實現有效的追蹤代謝物在代謝網絡中的流向和規律,是當今代謝組學研究的熱點及前沿領域。在代謝流組的研究上,超高的分辨率更顯的重要。
二、高質量精度
確保MS色譜峰每一個點的高質量精度 不同于一般的高分辨質譜,Orbitrap質譜平臺基于其獨特的原理及穩定性,可以確保色譜峰中每一個采集點都可獲得小于1ppm的質量精度,確保代謝物元素組成的準確計算。
同時提供 MSMS 小于1 ppm 的質量精度 Orbitrap質譜平臺可同時提供 MSMS 小于 1 ppm的質量精度,這對確保代謝物結構的精細鑒定至關重要。
三、與QQQ媲美的定量能力
一個平臺即可實現非靶標定性/靶標定量分析的完美整合 Orbitrap質譜平臺提供高靈敏、5 個數量級的動態范圍及靈活多樣的定量掃描模式,定性的同時具有極佳的定量能力。
四、極佳的穩定性
滿足代謝組學分析對于重現性的高度要求 Orbitrap質譜平臺因其獨特的結構及設計,提供代謝組學分析所需要的在質量精度、響應強度上的高重現性質譜數據,為組間的生物學差異比較提供可靠的基礎。
五、有效的正負離子切換掃描
提供大樣本分析的高通量 Orbitrap質譜平臺可以實現實時正負切換掃描功能,一次進樣即同時獲取正離子及負離子圖譜,且不損失靈敏度和質量精度,可以大大提高代謝組學大樣本分析的實驗通量。
強大的軟件方案
基于Orbitrap質譜平臺采集的高質量原始數據,賽默飛提供全面、強大的軟件平臺實現對代謝組學的數據處理及生物信息學挖掘。
一、SIEVE 軟件—專業的代謝組學數據處理、信息挖掘軟件
? 獨特的組分提取算法,綜合考慮歸屬于一個代謝物的所有質譜離子響應;
? 精細同位素匹配算法,更準確判斷代謝物元素組成;
? 主成分分析、T 檢驗等代謝組學統計模塊;
? 與 KEGG 等多種常用代謝組學數據庫相關聯,可自動對差異成分進行搜庫鑒定;
? Pathway Mapping。
二、強大的數據庫譜庫及結構解析軟件
mzCloud—多級譜庫及全未知代謝物結構解析;
? SIEVE 在 線 關 聯 HMDB、KEGG 等常用代謝組學數據庫;
? Mass Frontier 軟件—自動質譜譜圖結構解析軟件,Fragmentation Library TM碎裂譜圖庫,涵蓋了大于99%已發表的文獻涉及的碎裂機理,可對化合物的碎片離子進行預測,特有的包含15萬以上化學結構式及3萬以上碎片圖。
三、TraceFinder 軟件—高通量譜庫檢索及定量軟件
? 建立譜圖數據庫,便于數據管理,并可對化合物進行搜庫鑒定;
? 高通量目標代謝物篩查鑒定;
? 目標代謝物的高通量定量分析及熱圖;
? 定性篩查結果與定量方法的自動轉化。
基于 Orbitrap 超高分辨質譜平臺的代謝組學全流程解決方案,可以提供當今代謝組學研究最優異的平臺,在疾病生物標記物的尋找、食品組學、中醫藥等諸多領域全面迎接代謝組學研究的挑戰。
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