實驗材料 核酸
試劑、試劑盒 dNTPMnCl2MgCl2BSArTth DNA聚合酶
儀器、耗材 水浴鍋培養箱
實驗步驟
1. 用過氧化物酶,蛋白酶K和DNA酶預處理載玻片。
2. 配置如下一步反應體系(總體積100 μl)
(1)0.5 μl 100 μmol/l 正向引物(終濃度0.5 μmol/l)
(2)0.5 μl 100 μmol/l 反向引物(終濃度0.5 μmol/l)
(3)6 μl 3 mmol/l 4dNTP混合物(終濃度0.12 mmol/l)
(4)2 μl 10 mmol/l MnCl2(終濃度0.2 mmol/l)
(5)10 μl 25 mmol/l MgCl2(終濃度2.5 mmol/l)
(6)2 μl 10×rTth 轉錄緩沖液(終濃度0.2×)
(7)8 μl 10×螯合緩沖液(終濃度0.8×)
(8)10 μl 1.7 mg/ml BSA(終濃度0.17 mg/ml)
(9)2 μl 2.5 U/ml rTth DNA聚合酶(終濃度9.05 U/ml)
(10)29 μl DEPC處理過的水
3. 用20 μl 吸頭加8 μl(如用3孔載玻片)或12~20 μl (如用單孔載玻片)原位PCR擴增體系于各孔上,該液體覆蓋整個孔表面。
4. 放20 mm×60 mm 蓋玻片于每一載玻片上,小心用指甲油封住蓋玻片邊緣。
5. 在92℃加熱塊上,溫育玻片90 s。然后轉至熱循環儀。
6. 用步驟2所配一步反應體系代替原位PCR反應體系。
7. 按如下溫度循環程序進行反轉錄:
(1)1個循環:15 min,70℃
(2)3 min,92℃
(3)15 min,70℃
(4)3 min,92℃
(5)15 min,70℃
8. 按如下溫度循環程序進行原位PCR:
(1)29個循環:1 min,93℃(變性)
(2)1 min,53℃(退火)
(3)1 min,72℃(延伸)
(4)最后一步:不定,4℃(維持)
9. 由熱循環儀上取下載玻片,浸于100%乙醇中≥5 min 溶解指甲油,用剃須刀或其他小刀橇開蓋玻片,刮去殘留的指甲油,以便在雜交/檢測步驟中能平放上新的蓋玻片。
10. 在92℃加熱塊上溫育玻片1 min,然后于室溫下用2×SSC浸泡5 min。玻片在4℃可存敢2~3周。