（1）痰涂片抗酸染色查找抗酸桿菌3次以上（采用集菌法可提高陽性率）；結核分枝桿菌培養陽性可確診。亦可用超聲霧化導痰、下呼吸道采樣、支氣管沖洗液、支氣管肺泡灌洗液（BALF）、肺及支氣管活檢標本。
（2）兒童年幼不會吐痰，可在清晨初醒空腹時抽取胃液或胃洗出液替代痰標本檢查結核分枝桿菌。
（3）標本的陽性率與病變的性質和發展過程有關。原發結核病灶，病變范圍廣泛，有壞死液化；淋巴結結核波及支氣管形成支氣管結核及淋巴結支氣管瘺時檢出幾率高。
（4）涂片染色陽性只能說明抗酸桿菌存在，不能區分是結核分枝桿菌還是非結核分枝桿菌。由于我國非結核分枝桿菌病發病較少，故檢出抗酸桿菌結合臨床資料，對結核病診斷有重要意義。
（5）分離培養法陽性率高于涂片鏡檢法，是結核病診斷的金標準。分離培養陽性，有條件時應進行藥物敏感性試驗。