對于暴發型及病情嚴重的患者，如內科治療效果不佳的病例，會考慮手術治療。
一、潰瘍性結腸炎的內科治療
臥床休息和全身支持治療
包括液體和電解質平衡，尤其是鉀的補充，低血鉀者應予糾正。同時要注意蛋白質的補充，改善全身營養狀況，必要時應給予全胃腸道外營養支持，有貧血者可予輸血，胃腸道攝入時應盡量避免牛奶和乳制品。
二、潰瘍性結腸炎的藥物治療
1、柳氮磺胺吡啶水楊酸制劑是主要治療藥物，如艾迪莎、美沙拉嗪等。
2、皮質類固醇常用藥為強的松或地塞米松，但長期激素維持不可防止復發。在急性發作期亦可用氫化可的松或地塞米松靜脈滴注，以及每晚用氫化可的松加于生理鹽水中作保留灌腸，在急性發作期應用激素治療的價值是肯定的，但在慢性期是否應持續使用激素則尚有分歧，由于它有一定副作用，故多數不主張長期使用。
3、免疫抑制劑在潰瘍性結腸炎中的價值尚屬可疑。據Rosenberg等報道硫唑嘌呤在疾病惡化時并無控制疾病的作用，而在慢性病例中它卻有助于減少皮質類固醇的使用。
4、中藥治療腹瀉型潰瘍性結腸炎可用中醫中藥治療，效果比較理想。同時應注意飲食以及生活習慣。
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