一、凝膠的制備和電泳
由于氧能抑制丙烯酰胺的聚合反應,灌制聚丙烯酰胺凝膠常在兩塊封閉的玻璃平板所形成的夾層間進行。在這種裝置形式下,僅有頂層的凝膠與空氣中的氧氣相接觸,從而大大減少了氧對聚合的抑制作用。聚丙烯酰胺凝膠電泳一般采用垂直裝置。
二、凝膠的制備和電泳操作如下:
(1) 配制試劑
① 30%丙烯酰胺:100ml雙蒸水中含29g丙烯酰胺和1g N,N’-亞甲雙丙烯酰胺。
② 5×TBE
每升溶液含54g Tris.HCl,27.5g硼酸和20ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)。
③ 10%過硫酸銨:10ml雙蒸水中含1g過硫酸銨。
(2) 裝置膠模
將玻璃板和墊條事先用去污劑刷洗,并經自來水和無離子水沖洗干凈,晾干。裝置時,將較大的玻璃板平放在工作臺上,將兩個墊條放在玻璃板兩側,涂上少量凡士林,并將上層玻璃板置于墊條上,用夾子將玻板連同墊條夾緊,底部用1%瓊脂糖密封。為防止漏膠,除放梳子一邊外,其余三邊應用防水膠帶密封。
(3) 根據玻璃板大小及夾層厚薄計算所需凝膠溶液量,按下表配制溶液(100ml)。
將35μl TEMED加入100ml混合液中,混勻,然后均勻連續注入兩玻璃板空隙中。
(4) 立即插入電泳梳,勿使梳齒下形成氣泡。
(5) 室溫聚合1小時,梳齒下出現折光帶時,表明聚合反應已經完成。若凝膠不立即使用,可用紗布或濾紙(用1×TBE浸泡)包蓋于凝膠頂部,置4℃保存1-2天。
(6) 拔去梳子,立即用水沖洗加樣孔。
(7) 除去底部膠帶,將凝膠直立放入電泳槽。在上下兩槽中灌好1×TBE溶液,驅盡凝膠底部附著的氣泡。并用1×TBE溶液沖洗加樣孔;
(8) 將核酸樣品與適量6×凝膠加樣緩沖液(見表2-28)混合,并加入凝膠加樣孔中;
(9) 接通電源,正極與下槽連接。電壓一般控制在1.8v/cm。電壓過高時凝膠產生的熱量可造成DNA區帶彎曲,甚至引起小DNA片段的解鏈;
(10) 電泳畢,取下玻板和凝膠,放在工作臺上,從夾層一角輕撬,將上面的玻板輕輕移開,并小心揭下凝膠,置染色液中染色并進行結果觀察。
一、凝膠的制備和電泳由于氧能抑制丙烯酰胺的聚合反應,灌制聚丙烯酰胺凝膠常在兩塊封閉的玻璃平板所形成的夾層間進行。在這種裝置形式下,僅有頂層的凝膠與空氣中的氧氣相接觸,從而大大減少了氧對聚合的抑制作用。......
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