1.注意病因
注意有無腹部外傷、手術等創傷性因素，或急性闌尾炎、腸梗阻、十二指腸潰瘍穿孔、腫瘤、腸結核、克隆病、潰瘍性結腸炎等病理性原因。應詳詢有關病史、腸瘺的發生過程與治療情況。
2.明確腸瘺的部位與瘺管情況
（1）早期懷疑有瘺，但未見有明確的腸液或氣體從傷口溢出時，可口服染料或骨炭粉，觀察瘺管的分泌物有無染色。陽性結果能肯定腸瘺的診斷，但陰性結果不能排除腸瘺的存在。
（2）用注射器或洗創器（不用導管插入瘺管）對準瘺口，直接注入15%～20%水溶性碘造影劑40～60ml作瘺管造影，觀察瘺管的行徑、瘺管附近有無膿腔以及腸壁瘺口所在的部位。
（3）根據腸壁瘺口可能的部位，進行胃腸道鋇餐或鋇灌腸檢查，觀察瘺口及其近、遠側腸道的情況。
（4）對疑有腹腔膿腫的患者，應進行腹部超聲和CT檢查。
（5）對病理性腸瘺，應切取瘺管組織送病理切片檢查。
3.檢查
（1）收集24小時空腹流出的腸液、尿液，分別測定其量與電解質含量。
（2）采取瘺口、膿腔的分泌物作細菌培養（厭氧與需氧菌），必要時抽血送培養及作細菌的藥敏試驗。
（3）血液檢查：血膽紅素、白蛋白/球蛋白、葡萄糖、電解質（血鉀、鈉、氯、鈣、鎂、磷等）以及血尿素氮、肌酐、二氧化碳結合力。
（4）抽動脈血作血氣分析。
（5）嚴重腹腔感染時，常有多器官功能障礙，除進行上述各項檢查外，必要時攝胸片與作心電圖檢查。