同基因合子蛋白質C缺乏癥，或復合異基因合子蛋白質C缺乏癥（compound heterozygous protein C deficiency）通常在出生后至數日內發病，表現猛爆性紫斑癥或急性靜脈栓塞，有些蛋白質C低于20%的患者，會于兒童期或成年期初期發病。每位患者的癥狀并不一定相同，可能出現的情況如下：
1、胎兒腦部受損
2、胎兒眼睛受損
3、出生后發生猛爆性紫斑癥
4、皮膚產生進行性出血壞疽（Progressive hemorrhagic necrosis of skin）
5、皮膚血管栓塞、產生水泡或壞疽
6、瘀青及斑點散布
7、中樞神經系統及眼睛可能因血栓導致神經發展問題及失明。
癥狀若不治療，可能導致死亡。