雖然普遍意義上的質譜數據沒有唯一解，但只要限定研究的范圍和條件，那還是有解可循的。就如化合物的濃度與其UV響應的關系我們是沒法知道的，可在一個很窄的范圍內，就能用直線來近似他們的關系！那么如何限定質譜研究的范圍呢？首先我有幾項假設，所有的質譜推理都建立在它們之上：
?假設1：結構相似的化合物具有相同或相似的裂解規律；
?假設2：化合物的裂解行為的外因是質譜構造和碰撞能量，內因是分子結構特性，外因決定幾率，內因決定終點；
假設1首先肯定了在某些情況下，即結構相似，質譜的裂解數據是有規律可循的！結構相似，可以指有相同的官能團，或者在天然產物分類上屬于一類，比如都屬于黃酮、甾體、萜等。這個相似性越接近，那么它們具有相同的裂解形式的可能越大，同屬于查爾酮的化合物間的行為就比其他黃酮更接近。
假設2更進一指明了化合物的結構與質譜的關系，主要用來解決“為什么不同質譜儀器獲得的質譜數據有很大差別”（NMR不應該有這種情況）的問題，可以肯定一點，不同儀器獲得的數據是有規律可循的，這一點也為我們建立不同質譜儀器數據的智能解析程序鑒定了基礎（我們正在開發的一種秘密武器）！“外因決定幾率”指碎片離子在質譜圖上的豐度高低，“內因決定終點”是指可能存在哪些類型的碎片離子。
通過前面兩個假設，知道了質譜的規律性在一個很小的范圍內是可以成立的，那最關鍵的就是建立這一小類化合物的裂解規律，而如何建立裂解規律呢？要先從分析已知化合物的多級質譜入手。可是我們還不知道它們的裂解規律啊，怎么分析這些質譜數據呢？
我想這就是大多數人遇到的第一個難題了，獲得了質譜數據，即便是已知化合物的，也不知道那些棒棒們代表什么！在這里，我假定大家已經知道了最基本的質譜知識，比如full scan, MS/MS, 準分子離子，碎片離子，豐度等。
直接進入傳說中最神秘的“一三斷裂”，可以說“一三斷裂”是CID(碰撞誘導解析)質譜中最常見的裂解形式，與以往70eV的EI-MS非常不相同。EI-MS中的能量太高了，一般小分子的大部分結構單元都受不起這么高的能量，碎的面目全非；而ESI-MS中的CID溫和很多，并且碰撞的能量還不是一氣就全招呼上，慢慢來，一點一點的把化合物結構中不穩定的部位給敲掉。正是因為能量不高，化合物結構中不同基團的特異性差異才得以最大化的體現，也讓分子有機會擺好“一三”的pose后，才被打掉！說的專業一點，“一三斷裂”是一種能壘較低的裂解反應！大家熟知的麥式重排僅是“一三斷裂”的一個特列而已，據我所知，現有的小分子內的重排裂解都可歸到“一三斷裂”中！
“一三斷裂”是CID(碰撞誘導解析)質譜中 最常見的裂解形式。