抗凝血酶在血漿中的半衰期為大約3天。抗凝血酶在正常人類血漿中濃度約為0.12毫克/毫升,即約2.3μM。抗凝血酶已經被從人類以外的大量物種中分離取得，蛋白質和cDNA測序結果顯示，測序、牛、羊、兔和老鼠的抗凝血酶氨基酸鏈的長度均為433個殘基,超過人類的抗凝血酶一個氨基酸殘基，這個額外的氨基酸殘基被認為出現在第六位的氨基酸殘基位點上。牛,羊,兔子,老鼠,和人類抗凝血酶分享84到89%的氨基酸序列的一致性。三個單體內的六個氨基酸形成二硫鍵：Cys8-Cys128,Cys21-Cys95,Cys248-Cys430。四個潛在的N-糖基化位點位于在人類抗凝血酶一級結構96、135、155和192位置處的天冬酰胺(Asn)氨基酸殘基，在其他物種的抗凝血酶中也發生于相似的位置。在主要形式的人類抗凝血酶，即α-抗凝血酶，所有這些位點都被共價粘低聚糖側鏈附著，導致這種形式的抗凝血酶的分子量達58,200。次要形勢的抗凝血酶，β-抗凝血酶(約占10%左右)，其潛在的糖基化位點在135位的天冬酰胺不被占用。