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  • 發布時間:2023-09-12 14:32 原文鏈接: 擼貓都能擼出頂刊論文?她真的做到了……

    原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508342.shtm

    8月的最后一天,羅述金和她的團隊在《自然·生態與演化》上,發表了一篇與“大貓”華南虎有關的論文。

    羅述金是北京大學生命科學學院及北大-清華生命科學聯合中心的研究員,也是愛貓人士。她家里養著5只貓,實驗室里擺著標本和骨架,辦公桌旁貼著各種虎、貓的照片……

    她和她的團隊,是目前國內外少有的用分子遺傳學方法研究貓科動物的團隊。

    有些學生想做羅述金的研究生,給的理由是“因為我特別喜歡貓”。

    羅述金聽完笑了笑:“喜歡貓,養貓就好了。”

    在她看來,擼貓歸擼貓,科研歸科研,科研人擼貓該用一種別樣的姿勢。

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    今年年初,羅述金團隊在野外捕捉到豹貓并佩戴頸圈進行監測。受訪者供圖

    20年,解開華南虎被“污染”之謎

    最新發表的論文中,羅述金團隊補齊了華南虎出現前后的演化路徑。

    研究始于2004年,耗時近20年。

    2004年,羅述金還是美國明尼蘇達大學的博士生。她以封面文章形式在《公共科學圖書館-生物學》(PLoS Biology)上發表了人生中第一篇貓科動物研究論文。這篇論文改變了人們對虎的傳統認識,她發現現存虎還有第6個亞種“馬來虎”。

    做那項研究時,羅述金為不同亞種的虎檢測基因的過程中,意外發現了一個奇怪情況——圈養的華南虎種群里,有印支虎的遺傳信息。

    “會不會是圈養時錯誤引入印支虎‘污染’了華南虎?”羅述金心里打鼓。

    華南虎是中國獨有的虎,20世紀50-70年代間因大肆捕殺而從野外消失。1963年前后,華南虎的人工繁殖開始。

    一位朋友提醒羅述金:“如果最后發現是圈養管理的問題,豈不是會得罪很多人?”

    除了可能“得罪人”之外,羅述金還面臨著采樣困境——她必須要檢測野生華南虎的基因。但全球僅存的200多只華南虎均為圈養,去哪找野生的華南虎?

    羅述金不甘心:“但是,這個問題很重要,需要弄明白。”

    它不僅關乎華南虎的圈養管理,也關乎華南虎亞種的獨特性問題。

    唯一的可能,就是去找有明確地理來源信息的野生華南虎標本,可這些標本零星散布于世界各地的博物館。

    2011年,她在陜西動物研究所博物館和湖南師范大學,分別找到了1964年來自秦嶺的華南虎標本和1955年在岳麓山被擊斃的華南虎標本。2019年,她在美國自然歷史博物館,找到了1919年福建的華南虎樣本。她和合作伙伴也游走于全國各地,尋找虎骨、虎皮的蹤跡,就連神婆轎子里的虎皮坐墊都沒有放過,只可惜,大部分收藏者無法提供藏品的地理信息。

    但真正的轉機發生在2015年夏天。羅述金多年的合作者Yamaguchi在德法交界一個不知名的小鎮博物館里,發現了5份1905年華南虎亞種定名時的模式標本,并協助羅述金獲得了樣品。

    從這5份模式標本中,他們找到了與圈養華南虎類似的印支虎遺傳信息。

    羅述金懸著的心放了下來:“不是圈養的問題。”

    然而,危機并未解除。如果華南虎里有印支虎的遺傳信息,那么中國獨有的華南虎還能算是獨立的亞種嗎?

    幸好,采集到的華南虎樣本全基因組信息顯示,野生和圈養華南虎在全基因組層面依然是一個單系群。羅述金松了口氣:“華南虎依然是一個完整的亞種,它們的演化過程也是獨特的。”

    這項研究的結論是,在歷史上的冰期,中國西南山地成為老虎的避難所之一,冰期結束后,氣候回暖,虎隨著獵物分布區的擴散而遷徙,西南山地的虎種群遷徙到中國東部地區,與來自中南半島往北擴散的虎種群,在這里融合,形成華南虎,并繼續擴散到東北亞和中亞,形成東北虎和里海虎。

    “由此可見,中國東部地區形成了虎演化史上重要的‘基因大熔爐’,對于虎的分布格局有著重要的意義。”羅述金說。

    她的團隊歷時20年從全世界收集到的33份地理來源明確的博物館藏樣本,則組成了迄今最全面的華南虎遺傳資源庫。

    羅述金實驗室零下80攝氏度的大冰柜里,藏著二十年來采集到的各種樣本。倪思潔攝

    與“魔咒”共存

    論文刊出后,羅述金掐指一算:“還是沒有打破‘五年魔咒’啊。”

    這20年里,羅述金關于“大貓”“小貓”的論文發了20多篇,卻一直沒能走出老虎研究的“魔咒”。

    2004年發表第一篇關于虎演化的論文之后,她一直致力于虎的基因組學研究。

    2008年,她發現圈養虎保留了野生虎所沒有的基因組多樣性,以封面文章發表于《當代生物學》(Current Biology);

    2013年,她發現了決定白虎毛色的遺傳機制,再次以封面文章發表《當代生物學》;

    2018年,她用群體基因組學方法描繪出當時最完整的虎的自然史和演化史,第三次發表《當代生物學》,又是一篇封面文章;

    直到2023年,華南虎圈養群體混入印支虎遺傳信息的謎題隨著《自然·生態與演化》論文的發表最終得以破譯。

    這些與虎有關的頂刊論文之間,間隔期基本都是5年,羅述金笑稱其為“五年魔咒”。

    其實,羅述金的很多研究都要花五年、十年甚至更長時間,她也習慣了這種“慢”。在找不到樣本、前景不明的“間隔期”里,她總能找到做不完的“有意思的課題”。

    例如,早在1868年,達爾文曾記錄過一個有趣的現象,在東南亞地區廣泛分布著短尾的家貓,比例幾近一半。羅述金團隊對此好奇,尾形的多態性反映著物種的適應性演化或者獨特的種群歷史。

    為了解開謎團,實驗室開始家貓譜系繁殖。他們養了兩只貓,一只是雄性、正常尾長的美國短毛貓,一只是雌性、來自廣州的短尾流浪貓。兩只貓生下了3窩、18只小貓。他們通過基因組測序分析短尾貓家系的遺傳信息,同時分析從亞洲各地采到的數百只尾長多樣家貓的遺傳信息樣本,最終找到了與家貓短尾有關的遺傳變異基因,研究結果發在《科學通報》上。

    這些研究中,他們只需要觀測小貓的表型,給小貓采血,因此,小貓出生后不久,羅述金團隊全體人員一齊出動,廣發領養信息,為小貓們找好人家,而她自己家里,也“順便”落戶了3只。

    今年6月15日,羅述金發朋友圈,為小貓們慶祝9歲生日,她調侃說“作為‘實驗動物’能活到文章出來已經是非常規了吧,感謝各家的關愛和照顧,讓喵生幸福”。

    最近,羅述金團隊啟動了亞洲野貓遺傳演化的課題,探索在我國還不受大眾關注的這種珍稀瀕危小型貓科動物。她和學生在網上向公眾征集野貓和特定地區家貓的線索,并遠赴新疆和田,采集信息和樣品。

    同一時間,為了找到影響動物毛色的基因,她的團隊還在實驗室養起了有漂亮褐色斑紋的玉米蛇,繁殖譜系,取其蛇蛻做研究。一有客人來訪,羅述金就很開心地“請”出溫順的蛇媽媽,開啟了很多人第一次和蛇的“親密接觸”。

    科研團隊從野外帶回實驗室的貓科動物骨骼。倪思潔攝

    8月,科研團隊在新疆采集貓糞便。受訪者供圖

    “順其自然就是最好的歷練”

    羅述金喜歡貓,喜歡虎,喜歡很多動物,但這并不是她開啟研究的初衷。有時,她還會下意識地在“喜歡動物”和“研究動物”之間劃個邊界。

    羅述金本科就讀于北京大學生命科學學院,學的是生物化學和分子生物學專業。從當時在學院里講授“保護生物學”的“熊貓之父”潘文石教授身上,羅述金開了眼界:“原來中國也有野生動物的野外項目。”

    潘文石曾于上世紀80年代在臥龍和秦嶺的野地中對野生大熊貓進行了長達17年的研究,弄清了大熊貓瀕臨滅絕的真正原因。本科期間,羅述金跟著潘文石團隊一起去野外尋找白頭葉猴,開啟了野生動物探索之路。

    大學畢業,出國讀博,她選擇了當時中國學生很少會選的研究方向——保護生物學。

    “我希望將來能從事和野生動物有關的研究。至于研究對象是植物、鳥,還是貓,其實在開始的時候,并無所謂。”羅述金說。

    她選擇了在明尼蘇達大學從事野生虎保護研究的David Smith教授做導師。見面時,Smith教授坦誠地說:“我的經費不多,勉強能支撐你第一年。但我在美國國家癌癥研究所的同事Stephen O’Brien是世界上優秀的保護遺傳學家,或許你可以用遺傳學方法研究虎的保護和演化。”

    博士研究生的第二年,在David Smith和Stephen O’Brien兩位導師的共同引領下,羅述金正式走上貓科動物保護遺傳學研究之路。

    如今,羅述金關于貓的研究也得到了公眾的關注,她甚至會收到一些求助信息:“羅老師,可以幫忙呼吁呼吁流浪貓的救助問題嗎?”“羅老師,你看看我家的貓這是生了什么病?”

    羅述金盡可能地在喜歡貓和做科研之間劃一道線:“我不是做動物保護工作的,也不是獸醫。我的工作是研究,解答關于貓科動物的遺傳演化的問題。”

    “如果不是因為喜歡貓而做研究,那你是因為什么喜歡上研究的呢?”

    被問到這個問題時,羅述金眨了眨大大的眼睛:“可能我更喜歡那種像偵探一樣的感覺吧,從現存的蛛絲馬跡中探尋曾經發生過的事實。”她說,倘若當初學的不是生物學,她或許會選擇考古或是信息管理。

    現實生活中,她和她的團隊真的當起了“偵探”。他們擅長分子遺傳學技術,最近一年多,憑借這項技術,他們協助森林公安機關偵破了多起野生動物案件。在山區羊圈羊羔被害案件中,他們確定了捕獵的真兇;在佩戴頸圈豹貓遭遇報復性獵殺案件中,他們協助調查取證;他們還幫著鑒定被罰沒的云豹皮草大衣的真偽……

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    8月中旬,羅述金在新疆調研亞洲野貓和家貓時,與當地的小朋友和小貓合影。受訪者供圖

    生活中的羅述金,還熱愛運動。她曾經是北京冬奧會高山滑雪項目的競賽技術官員。但相比于滑雪,羅述金更喜歡登山和長跑,“登山、長跑是‘內啡肽型’運動,痛苦之后才會獲得快樂,滑雪、沖浪等更多是‘多巴胺型’運動,追求速度與刺激”。

    本科時,她參加了北大山鷹社,第一次上青藏高原,就直奔海拔6282米的阿尼瑪卿峰。2022年夏天,她在8天內先后登頂5396米的云南哈巴雪山和6178米的青海玉珠峰。

    不過,喜歡長跑的她一直想跑個“全馬”,但目前繁重的工作和生活之余的時間還只能支持她訓練半程馬拉松。

    羅述金說,“順其自然就是最好的歷練”。她認同一位美國同事的話:“衡量一次好的馬拉松,不是看用時多快配速多少,而是在跨過終點的瞬間,是否充滿愉悅,是否對下一次奔跑仍充滿期待。”

    “我在長跑訓練上比較懶散,至今為止也沒完成一次‘全馬’。但是,20年過去了,我還一直在路上跑。我想,這對我來說,才是最重要的吧。”羅述金說。

    9月1日,羅述金在辦公室。倪思潔攝

    相關論文鏈接:

    https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0020442

    https://doi.org/10.1016/j.cub.2008.03.053

    https://doi.org/10.1016/j.cub.2013.04.054

    https://doi.org/10.1016/j.cub.2018.09.019

    https://doi.org/10.1038/s41559-023-02185-8

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