來自第二軍醫大學、浙江大學醫學院和中國醫學科學院的研究人員報告稱，他們采用一種體內方法鑒別出了計算機算法無法預測到的目標miRNA,證實在肝癌中miR-92a作為一種致癌miRNA抑制了抑癌基因p21的表達。這一重要的研究發現發布在6月10日的《癌癥研究》（Cancer Research）雜志上。
我國著名的免疫學家曹雪濤（Xuetao Cao）院士是這篇論文的通訊作者。曹雪濤現任職第二軍醫大學、中國醫學科學院和浙江大學醫學院，主要從事腫瘤免疫治療和分子免疫學方面的研究，曾在樹突狀細胞的免疫學和腫瘤的免疫與基因治療研究方面獲得重要成果，以通訊作者的身份在Nature Immunology、Nature Communications、Immunity等國內外知名雜志發表論文200多篇。2013年當選為Cell雜志的新一屆編委（延伸閱讀：曹雪濤院士J Immunol解析表觀遺傳與免疫）。
肝癌是威脅人類生命的常見惡性腫瘤，其惡性程度高，預后差，居世界腫瘤死因譜第3位和我國腫瘤死因譜第2位。肝癌的發生、發展是一個多因素、多步驟、多基因作用的復雜過程。P21基因是一種重要的抑癌基因，如果其表達發生異常，將會影響細胞增殖與分化的調控，導致惡性腫瘤的發生。研究表明，p21可能通過不同的途經參與了肝癌的發生和發展。
miRNAs是一類長度在20—22個核苷酸的非編碼RNA分子，于1993年首次被人們發現。目前，人們所熟知的miRNA功能是通過3’端的UTR區與目的mRNA作用，在轉錄后調節基因的表達，選擇性降解mRNA或抑制基因翻譯。miRNAs失調與包括肝癌在內的許多人類癌癥的發生和發展關系密切。然而由于miRNAs和mRNA之間互作的復雜性，以及對于這些過程的調控機制所知有限，到目前為止鑒別出細胞中靶向特定mRNA的miRNAs仍是一個重大的挑戰。一些miRNAs無法通過當前可用的計算機算法預測出來。
在這篇新文章中作者們報告稱，利用p21 mRNA作為靶標，他們建立了一種稱作為miRNA體內沉淀（miRNA in vivo precipitation，miRIP）的新方法，來鑒別哪種類型的miRNAs實際結合了細胞中特定的mRNA。采用miRIP方法，研究人員發現了幾個計算機方法未預測到的，在HepG2和PC-3細胞中結合p21 mRNA的miRNAs。在這些miRNAs中，他們發現并證實一種叫做miR-92a的miRNA在HepG2和PC-3細胞中與p21 mRNA發生了強力互作。
研究人員證實在肝癌組織中miR-92a表達顯著升高，并且miR-92a表達增高與p21表達降低，及肝癌患者預后不良顯著相關。而抑制miR-92a則可在體內外通過上調p21顯著抑制肝癌生長。這些結果表明采用miRIP鑒別出的miR-92a作為一種致癌miRNA，通過抑制靶基因p21的表達與肝癌生長相關聯。
此外，研究人員還通過miRIP方法在HepG2細胞中鑒別出了幾個靶向STAT3 mRNA的miRNAs。他們的研究結果證實了，miRIP方法可以有效鑒別計算機方法無法預測，而存在于細胞內靶向特定mRNA的miRNAs。
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