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  • 發布時間:2020-04-20 21:01 原文鏈接: 環狀RNA研究方法(一)

    至2015起云序生物已經完成10000+例環狀RNA全轉錄組測序服務,涵蓋了50+疾病,20+物種,幫助眾多客戶在環狀RNA分子的研究中取得突破性進展。客戶發表的環狀RNA文章高達20篇以上。此外云序生物還提供環狀RNA機制研究手段,rip&RNA pull down技術,幫助客戶沖刺高分機制文章。本周小編來講講云序生物客戶利用全轉錄組測序如何又快速發表了一篇5分以上的文章(前期講述了好多篇環狀RNA測序直接發表5分的文章的案例,感興趣的伙伴可以點擊往期的鏈接)。 

     

    研究背景:

    作為非編碼分子的重要成員,環狀RNA分子在多種疾病生理學過程當中都扮演著重要的角色。這一次對于環狀RNA分子的研究聚焦在了電離輻射對細胞的影響。說起電離輻射,其實在我們的生活中微量輻射幾乎無處不在,土壤中有天然輻射源氡氣,體檢的時候使用的X射線機等等。要知道腸上皮細胞對(intestinal epithelium)電離放射是高度敏感的,腹部或者盆腔腫瘤病人在接受放放射治療后都會引起放射毒性造成的腸道損傷。那么問題來了,放射引起的腸道損傷較正常的腸道細胞,環狀RNA分子這一次是如何變化的?差異性的環狀分子功能如何?且聽小編慢慢的為您解讀這篇文章。

    實驗設計:

    整個實驗設計為對照組和照射處理組(實驗組),每組三個生物學重復。其中對照組為正常野生型小鼠,實驗組小鼠使用Cs137gamma光放射儀以恒定計量進行照射,3.5天后取兩組小鼠空腸組織提取RNA。

    圖1. 技術路線圖

    研究內容:

    1. 環狀RNA表達如何?差異表達的有哪些呢?

    高質量的測序服務,專業的生信分析,云序生物讓環狀研究變得容易,這是一條廣告。高質量的測序技術對每一個環狀的表達都做到精準檢測,生信分析可視化從宏觀角度(染色體分布、成環位置)給出了所有對于放射處理后在小鼠空腸組織當中環狀RNA分子的表達情況。

     

                                                                                                      

    圖2. 放射處理后小鼠空腸組織環狀RNA表達情況


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