帕金森病(PD)是一種常見的老年神經退行性疾病。近年來國內外大樣本全基因組關聯分析(GWAS)等研究發現了系列與PD相關的單核苷酸變異(SNP),但基因組上的結構變異、拷貝數變異和短串聯重復變異與PD的關系仍不明確。
近日,首都醫科大學宣武醫院神經內科教授王朝東、陳彪聯合華大基因研究院張建國研究員和劉漢奎助理研究員在npj Parkinson’s diseas期刊發表研究首次通過高深度全基因組測序,聯合長讀長、Sanger測序和定量PCR(qPCR)等技術確認了MUC19基因上1.6kb缺失變異、RXFP1基因上的12.4kb拷貝數變異和SLC2A13基因上的GGGAAA重復數目與帕金森病顯著相關。
同時,研究還發現SLC2A13和MUC19基因分別位于LRRK2基因的上下游,5拷貝的GGGAAA重復單元擴增和缺失型MUC19結構變異顯著降低了LRRK2 G2385R(最常見的東亞人群帕金森病相關變異)的發病風險。這一發現首次為G2385R找到了遺傳修飾因素,也為其臨床上表現的相對低外顯率提供了解釋。
此外,研究團隊還發現,人類染色體兩端5Mb的區間內帕金森患者的拷貝數變異負荷顯著更高。而且隨著年齡的增長,健康對照的染色體末端CNV負荷也隨之升高,提示了染色體端粒變異、衰老和帕金森病的關系。
據悉,王朝、劉漢奎為共同第一作者,陳彪、張建國為共同通訊作者。
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