研究開發出小分子RNA高通量測序數據整合分析軟件

　　高通量測序技術的普及帶來測序數據的高速增加，但分析工具的發展卻遠遠跟不上研究的需要。目前大多數高通量測序數據分析工具的用戶對象是具備一定數據分析能力的研究人員，大量的數據分析任務仍然落在少數生物信息實驗室上，嚴重阻礙了整個研究領域的發展。功能更強大、使用更方便的生物信息分析工具亟待開發。

　　為滿足廣大研究人員的需求，中國科學院遺傳與發育生物學研究所王秀杰課題組的研究人員開發了一套在線的小分子RNA高通量測序數據整合分析軟件ISRNA。該軟件提供了對高通量測序數據獲得的短序列進行查找、分析、比較等可視化流程分析，能夠幫助研究者高效準確地從海量數據中尋找有價值的信息，為系統研究小分子RNA提供了極大的便利。ISRNA可以快速地將短序列定位到基因組上，并統計分析基因組位置、長度分布和堿基組成傾向性等序列基本情況。ISRNA還能分析短序列與已知microRNA、其他種類的小分子RNA和編碼基因的對應情況，預測短序列周邊基因組區域的二級結構，查找短序列形成的小分子RNA簇等。此外，ISRNA提供了強大的搜索功能，用戶可以根據序列組成、表達豐度、基因組位置和編碼基因等內容檢索目標信息，還可以對不同的數據集進行比較。通過整合基因組可視化工具，ISRNA對大多數分析結果提供了圖形化展示。

　　該研究于12月3日在線發表于Bioinformatics雜志上。王秀杰研究組的駱觀正博士為論文第一作者。

　　該項研究得到了科技部和中國科學院的經費資助。