1.高熱者需與嚴重感染(如敗血癥)鑒別 甲亢危象以持續高熱伴大汗淋漓為特征，脈率增快比體溫升高更明顯，一般降溫及抗感染治療效果不佳。同時或多或少的存在其他甲亢表現。
2.冠心病心律失常，房顫、房撲等 甲亢危象者按一般心律失常治療效果不佳，用β受體阻滯劑效果較好。有其他方面甲亢表現存在是鑒別的重要依據。
3.以惡心、嘔吐及腹瀉為突出表現的甲亢危象可酷似急性胃腸炎。甲亢危象的腹瀉以便次增多，溏便或稀便為主，腹痛不明顯，大便常規無異常所見。可伴有大汗、心動過速等其他甲亢癥狀。
4.有昏迷或躁動不安伴肝功異常及黃疸的甲亢危象應與肝性腦病鑒別 病人昏迷情況難以用肝臟損害程度與血氨水平解釋及其他甲亢癥狀體征存在有助于鑒別診斷。
