近日,中國科學院植物研究所研究員秦國政團隊發現,RNA甲基化(m6A)修飾在不同類型果實的成熟調控中均發揮重要作用,但是作用機制有所不同。在番茄果實中,m6A修飾主要通過反饋調控DNA甲基化來發揮作用,而在草莓果實中,m6A修飾則通過調節ABA途徑的方式影響果實成熟,這為闡明果實成熟調控網絡提供了新視角。相關研究成果發表于《基因組生物學》。
果實中富含的營養成分是人類膳食結構的重要組成部分,對人體健康不可或缺。果實品質在成熟過程中逐漸形成,受到精確調控。解析果實成熟調控機制,將為果實品質改良和新品種選育提供理論基礎。
根據不同成熟機制,果實可分為呼吸躍變型(如番茄、蘋果、香蕉)和非呼吸躍變型(如草莓、葡萄、柑橘)。植物激素乙烯在呼吸躍變型果實的成熟調控中發揮關鍵作用,而脫落酸(ABA)則參與非呼吸躍變型果實成熟調控。 此前,秦國政團隊已經發現,m6A修飾參與呼吸躍變型果實番茄的成熟調控。然而,m6A在非呼吸躍變型果實成熟調控中的功能仍不清楚。
為此,研究人員比較了不同成熟階段草莓果實的m6A甲基組,發現m6A修飾在草莓果實成熟過程中呈現動態變化。與番茄果實類似,草莓果實中m6A修飾可富集在終止密碼子和3’UTR區域,且與基因表達呈負相關。而與番茄果實不同的是,草莓中m6A修飾還可大量富集于CDS區域,尤其在成熟啟動以后,該區域的m6A修飾整體上與基因表達呈正相關。差異m6A甲基組分析表明,ABA合成基因NCED5及信號轉導基因ABAR和AREB1的m6A水平在草莓果實成熟過程中顯著升高,m6A修飾可提高NCED5和AREB1的mRNA穩定性,并促進ABAR的翻譯效率。
進一步研究發現,m6A甲基轉移酶MTA和MTB正調控草莓果實成熟,且MTA在NCED5,ABAR和AREB1的m6A修飾中發揮重要作用。值得一提的是,在番茄果實中,m6A修飾可調節DNA去甲基酶基因的穩定性,而在草莓果實中,DNA去甲基酶基因卻不受m6A調控,說明m6A修飾通過不同的方式影響番茄和草莓果實成熟。
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