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  • 發布時間:2022-05-16 18:21 原文鏈接: 象腿蕉染色體級別基因組組裝研究獲進展

    象腿蕉(Ensete glaucum)是芭蕉科中耐寒的蕉類植物,原產于中國云南和東南亞地區,具有觀賞、飼用和藥用價值。中國科學院華南植物園教授John Seymour Heslop Harrison帶領的研究團隊,采用單分子納米孔、Illumina測序策略,結合染色體構像捕獲技術,發表了首個象腿蕉染色體級別的基因組序列,長度為481.5 Mbp,完整性較高(BUSCO 98.3%),注釋獲得36,836個編碼基因,重復序列約占基因組的55%。象腿蕉與芭蕉屬(Musa)代表物種的比較基因組學研究顯示,象腿蕉的長末端重復序列的組成及其插入時間,與芭蕉科其他物種均有差異,芭蕉屬比象腿蕉屬有更多Copia,象腿蕉LTR插入時間(峰值3.5-5 Mya)比芭蕉屬物種(峰值2 Mya)更古老;發現芭蕉科在9和11染色體基數進化過程中復雜多樣的染色體重組事件。該成果為蕉類作物保育和改良提供重要的基因組資源。  

      相關研究成果以A chromosome-level reference genome of Ensete glaucum gives insight into diversity and chromosomal and repetitive sequence evolution in the Musaceae為題,發表在Gigascience上。研究工作得到華南植物園海外知名學者項目、國家自然科學基金、廣東省基礎與應用基礎研究基金的支持。法國農業科學中心科研人員參與研究。

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