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  • 發布時間:2018-09-13 15:33 原文鏈接: 質譜立大功!首張人體肺部的脂質組圖譜出爐

      美國太平洋西北國家實驗室和羅切斯特大學領導的研究團隊近日利用質譜分析技術,繪制出第一張人體器官特異的脂質組圖譜–肺部。

      近年來,不同類型細胞的轉錄組和蛋白質組已經陸續發布,包括大腦、心臟和肝臟中的主要細胞類型,這些有助于我們更好地了解人體每個器官的功能。不過到目前為止,還沒有類似的脂質組(lipidome)圖譜。

      美國太平洋西北國家實驗室和羅切斯特大學領導的研究團隊近日利用質譜分析技術,繪制出第一張人體器官特異的脂質組圖譜–肺部。這項成果于本周發表在《Scientific Reports》雜志上。

      “對人體肺部各個細胞類型的脂質組進行鑒定,將有助于我們更好地了解肺部形成和功能的調控過程,”研究團隊在論文中指出。“基于液相色譜串聯質譜(LC-MS/MS)的脂質組學為檢測生物樣本的脂質組學特征提供了一種以無偏向的強大方法。”

      研究人員從三名20個月大的捐贈者那里獲得了肺部組織樣本。他們利用熒光激活細胞分選(FACS)技術,分離出四種主要的細胞類型:內皮細胞,上皮細胞,間充質細胞和混合免疫細胞。之后通過LC-MS/MS分析每種細胞類型特定的脂質組和蛋白質組。

      為了鑒定和量化所得到的脂質數據,研究人員使用了一種開源軟件LIQUID,這是他們在去年為脂質鑒定而開發的。他們發現了多種不同的脂質,具體包括5種脂類和21種亞類中的311種獨特脂質。這份獨特的圖譜似乎揭示了肺細胞如何相互作用和合作。

      “基于LC-MS/MS的四種肺細胞的脂質組學分析突出了各種細胞的獨特圖譜,揭示了肺臟內高度相關且協調的細胞網絡,它們支持關鍵的氣體交換功能和先天宿主反應。”研究人員總結道。

      “這些細胞類型特異的脂質數據,再加上細胞類型特異的轉錄物和蛋白質組數據,為研究肺部發育和功能提供了豐富資源。”他們寫道。

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