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  •   10月26日,由中國科學院西北高原生物研究所主持完成的青海省重大科技專項“三江源區代表性動物基因資源保護與應用”項目通過驗收。該項目由中國科學院西北高原生物研究所、動物研究所、昆明動物研究所和青海大學相關團隊共同參與完成。

      該項目聚焦三江源國家公園動物多樣性保護的重大科技需求,綜合利用第二代、第三代基因組測序及染色體構象捕獲技術,完成了19種青藏高原典型動物高質量參考基因組的組裝;重點解析了雪豹、野牦牛、藏野驢和高原魚類四個代表動物的種群動態歷史和演化特征;綜合利用比較基因組學和生物信息學等大規模數據分析平臺,深度挖掘了高原動物適應寒冷等極端環境的基因資源,搭建了青藏高原動物基因組數據庫平臺,截至項目驗收,數據庫共收錄動物基因組數據超過10TB,存儲動物組織、細胞等樣品3.26萬份,為三江源動物功能基因鑒定和基因資源利用提供了技術保障。該項目為相關部門提交重大決策咨詢建議3項,發表高水平論文26篇,出版專著2部,培養和引進人才9名(國家級人才2名),培養研究生27名。

      以“三代+二代+Hi-C”策略,該項目構建了野牦牛和家牦牛染色體水平高質量參考基因組,結合多組學數據發現了牦牛適應青藏高原極端環境的新機制。相關成果發表在《自然-通訊》(Nature Communications)上,同時被《科學》(Science)和新華社等報道。研究通過雪豹參考基因組及種群重測序數據發現,青藏高原存在南北兩種雪豹亞型,與其獵物分布較為一致,為青藏高原物種遺傳多樣性及適應提供了新見解。此外,該團隊發現高原魚類演化歷史與青藏高原地質事件相關,瀕危魚類經歷發全基因組復制,加倍基因主要富集于DNA修復、轉運等與高原環境適應相關通路,這將有助于進一步探討高原魚類的適應性進化,并為魚類的耐逆分子育種提供素材。

      此外,依托項目的相關成果,成立了青海省首家動植物損害鑒定機構——中國科學院西北高原生物研究所司法鑒定所。

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